壹、方舟系統
進入迷宮後，地圖左下角固定出現方舟。
方舟每層可以進入1次，是本迷宮最特色的系統。
進入方舟後，初始可用指揮部、提煉廠、制藥坊，其它建築(武裝部、訓練營、裝備部、研究室)需要修復後才可使用。
二、指揮部
指揮部用於升級其它建築，並可為部分建築分配居民，升級建築需要滿足居民總數和鋼材需求
10級以下消耗鋼材10+等級*2，居民每級增加4;
11級以上固定消耗鋼材30，居民每級增加2
三、提煉廠
提煉廠用於生產鋼材，最高10級，提升等級可增加居民來提升產出。
招募鐵匠後開啟分解裝備功能，分解裝備可獲得鋼材，分解6星裝備概率開啟發射核彈功能。
研究室-研究項目;制藥坊-制造藥品;裝備部-特色裝備;武裝部-攻擊特性;訓練營-先鋒特性的詳細介紹請見後續頁面。
四、研究室
用於生產研究資料和研究項目，首次翻找魔法學院拿到圖紙解鎖，最高10級，提升等級可增加居民來提升產出。
招募學者後研究項目最大等級由3級提升至5級，部分研究項目需要在迷宮中獲得道具後開啟。
研究項目詳解
*除核彈制造外，所有研究項目最大等級均為5級，升級需10/20/30/40/50研究資料
1.流水線車房
提煉廠，每層額外產出1/2/3/4/5塊鋼材
2.研究人才培訓
研究室，每層額外產出1/2/3/4/5份研究資料
3.武裝部擴建
武裝部，可額外放入2/4/6/8/10個居民
4.生命探測器
難民出現概率提升20/40/60/80/100%
5.訓練設施改進
先鋒特性效果提升20/40/60/80/100%
6.芳綸纖維
需要單兵外骨骼裝置(攜帶5號絕密檔案進入軍營暗門)
凱夫拉套裝屬性提升：受到傷害時，降低所受傷害10%(持續5輪，可疊加2/3/4/5/6層)
7.外骨骼系統
需要單兵外骨骼裝置
戰術套裝屬性提升：攻擊+15/30/45/60/75%
8.大口徑鉛彈
需要武器研發設備(攜帶6號絕密檔案進入工廠暗門)
Mog-3霰彈槍提升：攻擊時，若目標周圍沒有敵人，則造成額外傷害+10/20/30/40/50%
9.保險扳機
需要武器研發設備
XIM-9自動步槍提升：連射狀態下切換攻擊目標，損失5/4/3/2/1層連射層數
10.空尖彈
需要武器研發設備
D-7手持加農炮提升：攻擊時，10/20/30/40/50%概率附帶重傷效果
11.魔力內循環
需要魔法研究筆記(攜帶3號絕密檔案進入魔法學院暗門)
岡布奧提升：所有魔法效果+6/12/18/24/30%
12.火焰魔法精通
需要魔法研究筆記
岡布奧提升：攻擊強大活屍時，6/12/18/24/30%概率施放隨機火系傷害類魔法
13.行為方式分析
需要實驗體觀察資料(攜帶4號絕密檔案進入民居暗門)
岡布奧提升：出現新的敵人時，15/30/45/60/75%概率令其不看守周圍石板
14.變異基因解構
需要變異細胞皿(攜帶2號絕密檔案拆解基因註射中心)
岡布奧提升：使用基因改造藥劑時，恢復200/400/600/800/1000點生命值，且有20/40/60/80/100%概率清除自身所有負面狀態
15.變異細胞分解
需要變異細胞皿
岡布奧提升：降低所受感染傷害+20/40/60/80/100%
16.微型核彈制造
提煉廠分解6星裝備時，60%概率解鎖核彈功能
使用研究資料x50和鈈-239(解鎖核彈後分解6星裝備概率獲得)制造壹枚微型核彈，核彈在研究室制作後，在普通層方舟發射。
核彈發射後3層內對所有不帶輻射免疫的生物造成持續性傷害，最後1層後出現怪物輻射變異體，首次擊敗獲得5鉆。