四川科倫藥業廣安分公司
四川科倫醫藥貿易有限公司簡陽分公司
四川科倫貿易有限公司廣元分公司
四川科倫醫藥貿易有限公司金堂分公司
四川科倫藥業股份有限公司仁壽分公司
四川科倫醫藥貿易有限公司藥品分公司
四川科倫醫藥貿易有限公司宜賓分公司
四川科倫醫藥貿易有限公司攀枝花分公司
四川科倫醫藥貿易有限公司瀘州分公司
四川科倫醫藥貿易有限公司漢源分公司
四川科倫醫藥貿易有限公司瀘州分公司
四川省科倫醫藥貿易有限公司蒼溪分公司
與科倫藥業相關的分支機構有：
四川科倫藥物研究有限公司：公司所屬研發企業，成都市大輸液工程技術研究中心，國家博士後科研工作站；
湖南科倫制藥有限公司：湖南省優秀非公有制企業，中南地區最大的大容量註射劑生產基地；
黑龍江科倫制藥有限公司：向東北地區發展的大容量註射劑生產基地；
吉林科倫康乃爾制藥有限公司：在東北地區租賃經營的企業，為集團又壹個大容量註射劑生產基地；
江西科倫藥業有限公司：向江西地區發展的大容量註射劑生產基地；
昆明南疆制藥有限公司：向雲南地區發展的大容量註射劑生產基地；
山東科倫藥業有限公司：向山東地區發展的大容量註射劑生產基地；
湖南中南科倫藥業有限公司：集團凍幹粉針、粉針、小容量註射劑、口服固體制劑、中藥制劑生產基地，為“湖南省制造業信息化工程示範單位”；
四川珍珠制藥有限公司：口服固體制劑生產基地，生產片劑、膠囊、顆粒劑等多種劑型，四川省高新技術企業，四川省首批最具成長型中小企業100強；
四川新元制藥有限公司：原料藥生產基地；
湖北拓朋制藥有限公司：向湖北地區發展的大容量註射劑生產基地；
新都科倫藥用包裝有限公司：玻璃瓶輸液生產企業；
黑龍江科倫藥品包裝有限公司：向東北地區拓展的玻璃輸液瓶生產企業。