2、按來源不同，分為礦物源農藥（無機化合物）、生物源農藥（天然有機物、抗生素、微生物）及化學合成農藥三大類。
礦物源農藥是起源於天然礦物原料的無機化合物和石油的農藥。它包括砷化物、硫化物銅化物、磷化物和氟化物，以及石油乳劑等。目前使用較多的品種有硫懸浮劑、波爾多液等。
生物源農藥是指利用生物資源開發的農藥。它包括動物源農藥（如殺蟲雙、烯蟲酯、昆蟲性引誘劑、赤眼蜂等）植物源農藥（如除蟲菊素、印楝素、丁香油、乙烯利等）、微生物源農藥（井岡黴素、白僵菌、蘇雲金桿菌等）。
化學合成農藥由人工研制合成，並由化學工業生產的壹類農藥，其品種繁多（常用的約300種）應用範圍廣，藥效高。
另：
1. 殺蟲劑：按組成成分的分類
A 有機磷類 磷酸酯、壹硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、膦酸酯、磷酰胺、硫代磷酰胺、焦磷酸酯
B 氨基甲酸酯類 N－甲基氨基甲酸酯類、二甲基氨基甲酸酯
C 有機氮類 脒類、沙蠶毒類、脲類
D 擬除蟲菊酯類 光不穩定性擬除蟲菊酯、光穩定性擬除蟲菊酯
E 有機氯類
F 有機氟
G 無機殺蟲劑 是以天然礦物質為原料的無機化合物
H 植物性殺蟲劑
I 微生物殺蟲劑
J 昆蟲生長調節劑
K 昆蟲行為調節劑
2. 殺菌劑：
A 有機磷類 二硫代氨基甲酸鹽類、氨基磺酸類、硫代磺酸酯類、三氯甲硫基類
B 有機磷酸酯類
C 有機砷類
D 有機錫類
E 苯類
F 雜環類 苯並咪唑類、！噻英類、嘧啶類、三唑類、嗎啉類、吩嗪類、吡唑類、哌嗪類、喹啉類、苯並噻唑類、呋喃類
G 無機殺菌劑
H 微生物殺菌劑
3. 除草劑：
A 酰胺類
B 二硝基苯胺類
C 氨基甲酸酯類
D 脲類
E 酚類
F 二苯醚類
G 三氮苯類
H 苯氧羧酸類
I 有機磷類
J 雜環類
K 磺酰脲類
L 咪唑啉酮類
M 選擇性除草劑
N 滅生性除草劑
4. 殺鼠劑：
A 有機磷酸酯類
B 雜環類
C 脲類、硫脲類
D 有機氟
E 無機化合物
F 急性殺鼠劑
G 抗血凝殺鼠劑