如果藥店拖欠員工工資，員工應該通過法律途徑追討。他們可以向工會求助，向勞動監察投訴，申請勞動爭議仲裁，如果欠錢可以直接向人民法院申請支付令。
員工無權處置藥店的藥品。員工私自扣藥是違法的。就是利用職務之便將藥店的財物據為己有，從而迫使藥店付清他們的工資。如果員工沒有及時告知藥房，或者服用的藥物價值超標，就可能構成職務侵占。
勞工部
工資支付暫行規定
第七條工資必須在用人單位與勞動者約定的日期支付。如遇節假日或休息日，應在最近的工作日提前支付。工資每月至少發放壹次，實行周、日、小時工資制的，可以按周、日、小時發放工資。
勞動合同法
第三十條用人單位應當按照勞動合同的約定和國家規定，及時足額支付勞動者勞動報酬。
用人單位拖欠或者未足額支付勞動報酬的，勞動者可以依法向當地人民法院申請支付令，人民法院應當依法簽發支付令。
第八十五條用人單位有下列情形之壹的，由勞動行政部門責令限期支付勞動報酬、加班工資或者經濟補償；勞動報酬低於當地最低工資標準的，支付差額部分；逾期不支付的，責令用人單位按照應付金額50%以上100%以下的標準向勞動者支付賠償金:
(壹)未按照勞動合同的約定或者國家規定及時足額支付勞動者報酬的；
(二)低於當地最低工資標準支付勞動者工資的；
(三)安排加班而不支付加班費的；
(四)解除或者終止勞動合同，未依照本法規定向勞動者支付經濟補償的。
勞動爭議仲裁和調解法
第五條發生勞動爭議，當事人不願協商、協商不成或者達成和解協議後不履行的，可以向調解組織申請調解；不願調解、調解不成或者達成調解協議後不履行的，可以向勞動爭議仲裁委員會申請仲裁；對仲裁裁決不服的，除本法另有規定外，可以向人民法院提起訴訟。
第九條用人單位違反國家規定，拖欠或者未足額支付勞動報酬，或者拖欠工傷醫療費、經濟補償金或者賠償金的，勞動者可以向勞動行政部門投訴，勞動行政部門應當依法處理。
第五十壹條當事人應當按照規定的期限履行發生法律效力的調解書或者裁決書。壹方逾期不履行的，另壹方可以依照民事訴訟法的有關規定向人民法院申請執行。受理申請的人民法院應當依法執行。
民法通則
第七十二條財產所有權的取得不得違反法律。
依照合同或者其他合法方式取得財產的，財產所有權自財產交付時起轉移，但法律另有規定或者當事人另有約定的除外。
刑法
第271條職務侵占罪；貪汙罪公司、企業或者其他單位的人員，利用職務上的便利，將本單位的財物非法占為己有，數額較大的，處五年以下有期徒刑或者拘役；數額巨大的，處五年以上有期徒刑，可以並處沒收財產。
國有公司、企業或者其他國有單位中從事公務的人員和國有公司、企業或者其他國有單位委派到非國有公司、企業或者其他單位從事公務的人員有前款行為的，依照本法第三百八十二條、第三百八十三條的規定定罪處罰。