1，越獄第壹季
邁克爾·斯科菲爾德陷入了絕望的困境——他的兄弟林肯·巴羅斯被判謀殺罪，被關在福克斯河監獄的死囚牢房裏。盡管所有的證據都指出林肯是兇手，但邁克爾堅信他的哥哥是無辜的。
林肯的行刑日快到了。在沒有其他選擇的情況下，邁克爾持槍闖入壹家銀行，被捕入獄，後來到林肯身邊。
作為壹名建築工程師，邁克爾參與了監獄的改造工程，對此了如指掌。他設計了壹套完整的越獄計劃，入獄的唯壹目的就是拯救林肯的出生，還他清白。
林肯的前女友維羅妮卡·多諾萬是這起謀殺案的辯護律師。她認為林肯是被陷害的。在繼續調查的過程中，維羅妮卡發現這遠不是壹起簡單的謀殺案。受害者的死牽涉到很多重要人物的利益——副總統的身影逐漸從幕後浮現。
隨著調查的深入，危險正在逼近維羅妮卡，目擊者相繼被神秘殺害，林肯的家庭也遭遇了不幸。那個跟蹤維羅妮卡的神秘人原來是美國聯邦調查局的壹名特工。
與此同時，邁克爾在獄中艱難地準備著自己的越獄計劃，在通往自由的路上，意想不到的人和事接連出現。
2.越獄第二季
當邁克爾和林肯跑到歹徒阿布魯齊派來的飛機停著的地方時，飛行員因為安全問題沒等他們就走了。越獄的犯人只能仰望天空嘆息，於是開始了自己的逃亡生活。
追捕逃犯的美國聯邦調查局高級特工馬洪在副總裁的授權下成為抓捕組組長，他決定壹個壹個地破。另壹方面，莎拉的父親因為林肯的案子被殺。她開始相信邁克，並從她父親的遺物中得到線索。
當副總統的下屬凱勒曼去抓林肯的兒子LJ，準備拿他當人質時，他殺死了LJ的所有家人，但LJ意外逃脫。壹直在幫助林肯的律師們得到了越來越多的線索。所有的情節似乎都在慢慢解開。
3.越獄第三季
就在兩兄弟以為終於重生的時候，又被拉回到原點——這次越獄會更加危險。
就在邁克爾成功從福克斯河監獄救出被誣陷為殺人犯的哥哥林肯後，邁克爾、林肯和其他幾名越獄犯成為國家搜捕的目標，漸漸地剩下的囚犯被引向巴拿馬。
雖然隨著真相逐漸明朗，林肯已經被美國法院判無罪，但是兄弟倆的自由和幸福都很短暫，因為邁克爾很快就被“公司”送進了索納監獄，這個“公司”有政府背景，也是栽贓陷害林肯入獄的“公司”。
邁克爾很快意識到，他被送到這所監獄是為了讓他計劃另壹次看似極其困難、幾乎不可能的越獄。這壹次，他想幫助逃跑的人是魏斯勒，壹個住在下水道裏的非常神秘的囚犯。邁克爾被錯誤地帶到了索納，壹個巴拿馬的恐怖分子監獄。沒有法律，沒有獄警，也沒有逃跑的機會。
索納監獄與美國任何監獄都不壹樣，曾經發生過讓獄警和相關部門敬而遠之的囚犯暴動。之後獄警只在離監獄幾十米遠的圍欄處看守。在監獄裏，讓囚犯們自生自滅，但現在真正內部管理監獄的是囚犯老板盧西耶洛。
自從到了索納監獄，邁克爾要做的就是避免讓獄友老板盧西亞諾起疑心或者得罪他，同時還要提防和他壹起入獄的三名犯人。
以防逃亡計劃更有可能破產:叛變的美國聯邦調查局特工馬宏也卷入了“公司”事務。巴裏克是福克斯河監獄的前獄警，他想追捕逃犯以獲得獎勵，不想自己坐牢。西奧多·巴格威爾獨臂變態殺人犯。
另壹方面，林肯需要幫助越獄，因為只有成功越獄才能拯救他的兒子LJ和邁克爾心愛的女友莎拉。在巴拿馬，林肯會見了蘇克雷，另壹名福克斯河監獄的逃犯。
同時認識了兩個美女:蘇珊，公司裏壹個無情的女人。維斯勒的無辜女友索菲亞，沒想到危險臨近了。
時間非常有限，邁克爾和林肯必須盡快找到與親人團聚的地方，摧毀“公司”，進行最艱難的逃亡計劃。
4.越獄第四季
邁克爾在洛杉磯找到了格雷琴和威斯勒，並得知莎拉還活著。通過莎拉父親的好朋友布魯斯·貝奈特先生，邁克爾找到了莎拉，他們終於又見面了。
在巴拿馬，蘇克雷、巴裏克和西奧多也在壹場暴亂中從索納監獄逃脫。這個時候，自稱是美國國家安全局特工的丹·大陸架(Dan Shelf)來到大家面前，要求大家配合他搞垮壹家公司。他們必須潛入壹個神秘的地方，竊取與公司有關的信息，然後用這些信息換取自由。
5.越獄第五季
根據T-BAG提供的信息，Lincoln和Sarah發現Michael其實還活著，被ISIL關押在也門壹個叫Ojezia的監獄裏。之後，他們開始計劃不僅要幫助邁克爾越獄，還要幫助他逃離也門這個國家，壹起將所有在幕後操縱的波塞冬繩之以法。