此舉主要是改革加工貿易監管方式，遏制加工貿易走私現象。
加工貿易是中國改革開放和利用外資的產物。過去二十年，中國加工貿易進出口總額增長了70倍。加工貿易占中國對外貿易的壹半。今年前5個月，中國加工貿易進出口達850億美元，比去年同期增長30%，占全國進出口總額的49%。
隨著加工貿易的快速發展，加工貿易衍生的走私現象也越來越嚴重，如利用“假單證、假簽章”走私、假報告隱瞞、飛料走私、出口騙稅等。去年，中國海關查獲加工貿易走私大案四百四十七起，案值近二十九億元。今年前5個月，查獲加工貿易渠道重大走私案件137起，案值8.4億元，約占全國海關查獲的重大走私案件總數和案值的壹半。
加工貿易走私猖獗是因為我國對加工貿易進口料件實行免稅待遇，走私有利可圖。也與中國特色加工貿易的“遍地開花”、“滿山放羊”有關。加工貿易在西方國家對外貿易中的比重很小，而東亞“四小龍”在出口加工區實行加工貿易集中管理。
近年來，我國政府大力加強對加工貿易的管理，並出臺了加工貿易進口料件保證金“臺帳制度”，但在遏制加工貿易走私方面效果不佳。自中國開展聲勢浩大的反走私運動以來，還計劃改革加工貿易監管模式，對加工貿易貨物和企業實行分類管理。
政策出臺前，外商反應強烈，尤其是在東南沿海投資的港臺商人，認為中國不再歡迎加工貿易。中國政府意識到加工貿易為中國的對外開放和利用外資做出了巨大貢獻，並順應中國參與全球經濟分工與合作的大趨勢，多次表示加工貿易的總政策沒有改變，對任何可能影響加工貿易正常發展的新措施的出臺始終持謹慎態度。
在國務院批準的現有經濟技術開發區設立出口加工區，對加工貿易實行“圈養式”封閉管理，也是中國政府經過深思熟慮後做出的改革加工貿易管理方式的重要決策。這壹符合國際慣例的舉措，不僅將提高守法企業的通關效率，為其提供更加寬松的管理，也有助於改變經營分散、監管難的現狀，相信將促進我國加工貿易的健康發展。