70年代初在原石油化學工業部醫藥工業管理局任經理。參與制定並組織實施了中國藥物制劑技術科學技術研究計劃。70年代中期至80年代初，負責組織實施中成藥行業機械化及相關技術的科技規劃。
20世紀80年代中期，任德全教授負責組織我國醫藥行業的科學研究和科技攻關，在醫藥行業的科學研究中倡導和實施GLP。期間還擔任中國藥材公司董事、副總經理，並被聘為聯合國世界工業發展組織中國傳統醫藥顧問。
20世紀80年代末起，任德全教授擔任國家中醫藥管理局科技教育司司長、中國藥學會學術部副理事長、國家“863生物技術”專家委員、中國中醫藥經濟研究會會長。在此期間，他負責中國醫藥行業的新藥研究。在任德全教授的倡導和組織下，我國基因工程藥物已進入產業化階段，如GMCSF、EPO的國產化生產。
20世紀90年代以來，倡導中藥現代化，組織實施中藥行業GMP，提出並實施中藥行業GAP，提出並實施中藥質量控制指紋圖譜。作為中國政府代表團的壹員，我和吳儀團長壹起參加了中美知識產權談判。而且參與了三輪中美知識產權談判的全過程，具體負責醫療領域的知識產權談判。同時還擔任中國醫藥公司總經理、中國醫藥商業協會會長。
90年代中期起任國家中醫藥管理局副局長、國家醫藥產品管理局副局長。
本世紀初，他擔任國家美國食品藥品監督管理局副主任，並當選為中國藥學會制藥工程專業委員會主任委員。他還被聘為華東理工大學的兼職教授和北京中醫藥大學的客座教授。在此期間，任德全教授還倡導中醫療效指標量化的科學研究，如舌診、脈診的可視化和數字化。