食品生產許可證又稱QS，適用於食品生產加工環節和生產區域，是對生產組織頒發的證書。比如從事糕點、豆制品、酒類、乳制品、特殊膳食食品、特殊醫學用途配方食品、嬰幼兒配方食品等生產活動的企業法人、合夥企業、個人獨資企業和個體工商戶等。，需要市級壹級食藥監局審核食品生產許可，縣級食藥監局提供咨詢服務。
食品經營許可證適用於食品銷售流通環節和銷售區域。從事食品銷售和餐飲服務活動的，應當依法取得食品經營許可證。例如，我們經常看到餐館、商店、大學超市、冷飲店、面包店等。都需要辦理食品經營許可證。任何參與食品銷售和流通的人都需要申請這個許可證。基本上個體工商戶和個人獨資企業都需要申請，資格由食品藥品監督管理局下放。
食品經營許可證與食品生產許可證的主要區別在於，食品生產許可證有詳細的審查細則，需要具備產品標準、出廠檢驗能力等硬件條件。食品企業無需遵守本規則的規定。可以看出，這兩個許可證的辦理都是為了保護和規範食品行業，從而保證我們的食品安全和衛生。
法律依據
個體工商戶登記管理辦法
第二十四條個體工商戶營業執照(以下簡稱營業執照)分為正本和副本，正本和副本載明個體工商戶名稱、經營者名稱、組成形式、經營場所、經營範圍、登記日期和編號、發證機關和發證時間等信息，正本和副本具有同等法律效力。第二十八條有下列情形之壹的，登記主管機關或者其上級機關可以應利害關系人的請求或者依職權註銷個體工商戶登記:
(壹)登記機關工作人員濫用職權、玩忽職守，作出準予登記決定的；
(二)超越法定權限作出準予登記決定的；
(三)違反法定程序作出準予登記決定的；
(四)對不具備申請資格或者不符合法定條件的申請人準予註冊的；
(五)依法可以撤銷註冊的其他情形。
申請人以欺騙、賄賂等不正當手段取得個體工商戶登記的，應當予以撤銷。
依照前兩款規定註銷個體工商戶登記可能對社會公眾利益造成重大損害的，不予撤銷。
依照本條第壹款規定註銷個體工商戶登記，經營者合法權益受到損害的，行政機關應當依法予以賠償。