(1)抗生素類：常用的有土黴素、青黴素、強力黴素、金黴素、甲碸黴素、氟苯尼考等。 (2)磺胺類：有磺胺嘧啶、磺胺甲基嘧啶、磺胺間甲氧嘧啶、甲氧芐氨嘧啶等。磺胺類藥物在鰻魚飼料添加劑中已禁止使用。
(3)喹諾酮類：有氟哌酸(諾氟沙星)、氟嗪酸(氧氟沙星)、吡哌酸、f喹酸、萘啶酸等。此類藥物抗菌效果普遍較好，具有抗菌範圍廣、殺菌能力強等優點，是防治水產動物細菌病的有效藥物。
在抗菌類藥物中，抗生素類中的紅黴素、氯黴素、泰樂菌素、桿菌肽鋅已被禁止用於魚病防治及作為飼料藥物添加劑。磺胺類中的磺胺噻唑(消治龍)、磺胺咪(磺胺呱)被禁用。喹諾酮類中的環丙沙星已被禁用，恩諾沙星藥殘已作為限制鰻魚出口日本的壹主要因子。另壹類抗菌藥物硝基呋喃類中的呋喃唑酮(商品名為痢特靈)、呋喃西林(又名呋喃新)、呋喃它酮、呋喃那斯也已被禁用。養殖戶在生產過程中可用其它抗菌藥物代替。
2．水體消毒劑
常用的水體消毒劑有以下幾類；
(1)鹵素類：聚維酮碘(碘伏)、二氯異氰尿酸鈉、三氯乙氰尿酸、溴氯海因、二溴海因、二氧化氯、漂白粉等。
(2)醛類、醇類：甲醛溶液(福爾馬林)、戊二醛、乙醇(酒精)等。 (3)堿類：氧化鈣(生石灰)、氫氧化銨溶液(氨水)等。
(4)氧化劑：高錳酸鉀、過氧化鈣、過氧乙酸、雙氧水(過氧化氫)等。
(5)重金屬鹽類：螯合銅、硫酸銅等。高濃度的重金屬鹽有殺菌作用，低濃度具有抑制酶系統活性基團的作用，表現為抑菌效果。 (6)表面活性劑：新潔爾滅、季銨鹽類等。
(7)染料類：甲紫、亞甲基藍、吖啶黃等。染料可分為堿性和酸性兩大類，影響生物代謝。
3．抗寄生蟲藥物
(1)染料類藥物：常用的有亞甲基藍等，可防治魚卵的水黴病、幼魚和成魚的小瓜蟲病、車輪蟲病、斜管蟲病等。
(2)重金屬類：硫酸銅、硫酸亞鐵合劑。
(3)有機磷殺蟲劑：如敵百蟲。
(4)擬除蟲菊酯殺蟲藥：如溴氰菊酯等。
(5)咪唑類殺蟲劑：甲苯咪唑、丙硫咪唑等。 必須註意過量的銅可造成魚體內重金屬積累，而敵百蟲在弱堿性條件下形成敵敵畏，其對人的危害極大。
在抗寄生蟲藥物當中，孔雀石綠具有強毒、危害人體健康，有致癌性，已被禁用，在生產中可用亞甲基蘭代替。另壹類汞制劑殺蟲劑如硝酸亞汞、氯化亞汞、醋酸汞、甘汞（二氧化汞）、吡啶基醋酸汞等各個種類已被禁止使用。擬除蟲菊酯中氟氯氰菊酯(又名百樹得、百樹菊酯)、氟氰戊菊酯被禁用，此類藥物雖未全禁，但還是少用為好。另外多種農藥如地蟲硫磷、六六六、毒殺酚、滴滴涕DDT、呋喃丹(克百威)、殺蟲脒、雙甲脒等被禁用。養殖戶應杜絕使用這些種類藥物，可用其他殺蟲劑代替使用