（2）藥用植物資源的二級開發，壹級開發是將壹級開發提供的資源或粗品，轉化為優質高效的藥物制劑或其他產品。當前應重點解決常用藥、滋補強壯保健藥、保健食品等。如利用野生資源中的多種小檗和十大功勞以及馬尾黃連等，加工提取黃連素，再由黃連素加工成黃連素片劑。矮腳茶資源豐富，在民間用於治療慢性支氣管炎，通過分類、化學成分、藥理和臨床研究，發現種子去油後的殘渣中含有止咳巖藻素等十多種成分，經慢性支氣管炎患者臨床應用，有效率達60%～80%，現正研制成止咳、祛痰的巖藻素片新藥。並在苴麻屬落新婦屬和巖白菜屬中發現了巖大白菜成分，拓展了巖白菜素片的新資源。又如成功引進的玫瑰果和西番蓮，因其果實和花萼富含維生素等營養成分，已被加工成各種保健飲料。
（3）藥用植物資源的三級開發，三級開發就是運用綜合研究手段尋找新藥新資源。當前，應著重從傳統醫藥中發現線索，開辟新藥新資源。例如，直接從藥用植物中提取的天然成分制成新藥用於臨床的有青蒿素、青蒿素 A、丁酸生物堿、單端孢黴烯、烏頭堿 3-乙酸、芫荽酯 A、天花粉蛋白等。上述三個方面既有相對的層次性，又相互關聯。壹種新藥的成功開發（三級開發），最終要以藥品和商品的形式出現（二級開發），同時也需要更多的藥材和原料供應（壹級開發），綜合研究的方法和手段，在各級開發中都是必不可少的。