六神丸性味寒涼，是壹種克伐之品。其中，丸中的蟾酥是蟾蜍耳後腺和皮膚腺的漿汁樣分泌物，有很大的毒性。此藥中毒輕則惡心嘔吐、腹痛腹瀉，重則引起心肌中毒，心律紊亂，出現胸悶心慌、煩躁抽搐，嚴重者可引起心跳猝停，以致死亡。因此，小兒在服用含蟾酥成份的六神丸時，切勿濫用，更不能把它當“小兒奇應丸”類中成藥退燒使用，必要時，應在醫生的正確指導下，辯證使用，但要嚴格控制劑量，不可久服。
馳名中外的六神丸是家庭常備良藥之壹。主要由牛黃、麝香、蟾酥、雄黃、冰片、珍珠六味藥等組成，方中還含有朱砂。具有清熱解毒、消腫止痛等功效，常用於咽喉腫痛、扁桃體炎、口舌糜爛、牙周炎及癰疽瘡癤、無名腫痛等癥。但是需註意的是，用六神丸有六不宜。
壹、孕婦不宜：六神丸含麝香和雄黃等成分，麝香能引起子宮收縮，會引起流產或早產；孕婦亦忌雄黃，故孕婦禁用。
二、嬰兒不宜：六神丸含有蟾酥，其有效成分為蟾毒素等，壹次服過量即可引起中毒。故兩歲以下的嬰兒應慎用，新生兒禁用。三、不宜與地高辛合用：因心衰或房顫服地高辛的心臟病人忌服六神丸。
二者合用可導致地高辛樣中毒，可引起心動過緩和心律失常。
四、不宜與消化酶合用：六神丸有抑制消化酶的作用，因此不宜與助消化藥多酶片、胃蛋白酶及澱粉酶合用，否則會使消化酶降低療效或失效。
五、不宜與阿托品聯用：六神丸不宜與硫酸鹽同服（如硫酸阿托品、硫酸亞鐵等），硫酸鹽會促使雄黃中的硫化砷氧化，會增加雄黃的毒性反應。
六、不宜與華素片合用：華素片中含有碘分子，含碘的華素片與含朱砂的六神丸同時服，因朱砂中的二價汞能與碘結合，形成碘化汞類有毒汞鹽沈澱，可導致藥物性腸炎。
此外，由於六神丸性香燥，易敗胃，凡脾胃不足、身體虛弱者應慎用或禁用。對本品過敏者忌用。