《滲透》劇情分集簡介如下：
第1-5集：抗戰進入尾聲，在重慶，大學生許忠義因生計所迫誤入軍統。許忠義向楊克成表示，只要組織上寬恕他的過去，這輩子就壹心壹意跟定***產黨。許忠義在於秀凝的授意下登門拜訪，很快便得到了李維恭的信任。
第6-10集：齊公子認定許忠義已經成了***產黨，開始密切監視許忠義的行蹤。壹次巧合令許忠義意識到自己可能被監聽了。齊公子將範圍鎖定了小丫頭所在的師範學校，而且獲知許忠義在相應時間竟然也去過學校。小丫頭認為許忠義沒能盡全力營救老孟，從而心生怨恨。
第11-15集：許忠義利用李維恭，采購儲備壹批藥品。同時，許忠義向李維恭匯報齊公子把竊聽器安裝在自己家裏的事。招待所裏，許忠義查明此次李維恭行動真相的努力毫無進展，這讓他和小丫頭焦急萬分。所有被軟禁的人也變得性情急躁，陳明，於秀凝不斷與齊公子發生沖突。
第16-20集：齊公子已經確認顧雨菲就是在招待所中殺死看守的人，隨即將她關押起來。很快，小丫頭也突然失蹤了。這是齊公子綁架了小丫頭，希望從小丫頭這裏得到許忠義是地下黨的證據。因為齊公子的計劃被趙致泄露了只言片語，他決意要殺害小丫頭。
第21-25集：許忠義的情報被齊公子從丟棄的軍服裏找到了。雖然那份情報本身無法證明出自許忠義之手，但齊公子心裏卻早已經認定了。許忠義決定把地點選在自己控制的招待所的浴室。齊公子安插在招待所裏的內線發現了這個動向。齊公子隨即采取行動。
第26-30集：地下黨在沈陽發起的學生反內戰示威運動如火如荼，顧雨菲到齊公子家中遊說，承諾只要齊公子在許忠義的問題上保持中立，許忠義便願意幫助他解決問題。許忠義得知李維恭自殺身亡的消息之後既驚訝又但心，他迅速趕到其家中，沒有發現什麽證據。
第31-34集：許忠義等三人回歸部隊，楊克成也得到齊公子即將離開沈陽的電報。許忠義得知這壹消息決定不顧個人安危，重返沈陽攔截齊公子的“滲透計劃”。與齊公子短兵相接，危急關頭，楊克成和顧雨菲帶著壹隊戰士趕到，擊斃齊公子，終於截獲了那份“滲透計劃”。
劇集評價：
正面評價：電視劇《滲透》以嶄新的視角塑造人物、講述故事，從可信可氣可愛可笑的小人物著手，巧妙地營造輕松的故事氛圍。作品情節緊湊、不拖泥帶水，為觀眾上演了壹出“滲透無聲”新款諜戰劇。《滲透》不經意間觸及了當下最敏感的社會話題。
反面評價：2009年大火的《潛伏》把人們對諜戰戲的預期提高了兩三個等級，這就讓《滲透》多少有點尷尬：劇情稍有漏洞就顯得智商不夠、演員稍有做作就顯得壓不住場——總之，雖然主線故事和《潛伏》頗為相似，但各方面的表現都要差不少，這終究會拖累觀眾的口碑。