根據上述職責，省經濟和信息化委員會設立省國防科技工業辦公室和34個職能處室。其中，省國防科技工業辦公室歸口管理軍工管理處和民爆器材監管處。
辦公室綜合協調和督查委機關日常政務；建立健全機關各項規章制度；實施年度工作目標責任制並進行考評；負責機關重要會議的組織和文電、信息、機要、保密、政務公開、檔案、信訪、宣傳、安全保衛、電子政務等工作；組織辦理人大代表建議和政協委員提案；負責委機關和系統的計算機網絡建設和日常運行管理；承擔委辦事大廳的日常管理工作。
財務審計處負責委機關財務管理和會計核算工作；指導委屬單位的財務管理、會計業務和財務監管工作；負責委屬單位的資產監管，辦理國有資產的購置、變更、移交、處置報批工作，監督指導國有資產的管理；負責委機關、委屬單位和派出機構審計工作；牽頭開展財政資金使用的績效評價工作。
政策研究室提出經濟和信息化發展戰略、方針、政策和措施；對經濟和信息化領域調控政策的實施效果進行評估；研究制定企業改革和發展的政策措施；負責全委研究課題管理，提出年度課題計劃，組織和承擔重大課題研究。
法規處組織擬訂經濟和信息化方面的地方性法規、規章草案，組織制定行業技術規範、行業標準，組織開展法規、規章和技術規範、行業標準執行情況的監督檢查；組織制定和審核全委行政規範性文件；承擔行政復議與行政應訴工作；負責系統內普法和執法隊伍建設，指導企業法律顧問工作；指導和規範相關協會建設。
綜合處綜合分析經濟和信息化發展的重大問題，提出全局性工作思路，起草全省性經濟和信息化工作報告；組織編制經濟和信息化、相關行業規劃；分析全省經濟形勢，起草季度和年度全省經濟形勢報告，提出調節近期經濟運行的對策措施；負責委新聞發布，組織產業指導信息發布。
經濟運行處（掛交通郵電處牌子）監測、分析全省日常經濟運行態勢，起草月度工業經濟形勢報告，組織調研經濟運行中的熱點、難點問題並提出對策建議；監測、分析煤電油運的運行態勢和市場狀況，擬訂並組織實施煤電油運等要素保障的政策措施；做好煤炭、成品油（含燃料油）等要素保障；制定成品油生產、供應、儲備年度計劃並組織考核和檢查，協調成品油市場供應調度，組織推廣清潔油品的生產和使用；承擔煤炭應急儲備的管理工作；組織重點物資的緊急調運和各種交通運輸方式綜合協調，協調全省春運工作；承擔省煤電油運協調工作聯席會議辦公室、省春運工作領導小組辦公室的日常工作和全省無人看守道口監管協調等相關工作。
產業投資處（掛技術改造處牌子）組織擬訂工業和信息化產業發展專項規劃，擬訂產業投資規模和結構調控目標、政策及措施；負責申報、核準、備案企業技術改造（含利用外資）項目；會同相關處室牽頭提出省財政用於工業轉型升級專項資金的安排意見；承擔技改投資項目進口和國產設備抵免稅審核確認工作；指導企業技術改造項目招投標活動的監督管理工作；制定技術改造投資項目管理辦法，參與制定企業投資體制改革方案和重大工業建設項目投資的有關工作。
技術進步與裝備處擬訂企業技術進步的政策措施，組織實施國家和省重大技術攻關項目；推進企業技術創新體系和能力建設，培育與管理企業技術中心，組織實施重大裝備國產化和重大技術裝備、應對技術壁壘專項；研究提出技術創新的政策，推動企業實施技術創新、技術引進、新產品開發和高新技術產業化項目，參與指導企業知識產權工作；組織協調產學研合作創新工作；承擔省應對技術性貿易壁壘聯席會議辦公室的日常工作。
資源節約與綜合利用處承擔全省節能降耗和資源綜合利用綜合協調的有關工作，指導工業循環經濟、清潔生產、新能源推廣應用工作。擬訂節能、工業節水、資源節約綜合利用、清潔生產、環保產業的政策措施，組織協調新能源推廣應用、項目示範；承擔全省資源綜合利用認定、組織協調和監督管理；承擔高耗能固定資產投資項目的節能審查和節能產品認定的核準；推進工業循環經濟、清潔生產，培育和發展節能環保等新興產業；指導新型墻體材料的生產及推廣應用；指導能源利用監察（監測）和執法工作；承擔省節能減排工作領導小組節能降耗辦公室、省光伏等新能源推廣應用與產業發展協調小組辦公室的日常工作。
電力處承擔全省電力運行管理，協調電力供需、電網運行中的有關問題；承擔全省電力電量綜合平衡和電力年度計劃編制及管理，監督指導電力調度；承擔電力需求側管理和有序用電，指導節約用電，牽頭處置大面積停電事故；按照權限和分工核準資源綜合利用和新能源發電項目；承擔熱電聯產、集中供熱的改造建設；承擔電力工業“上大壓小”工作；劃分和管理供電營業區，指導新農村電氣化縣建設；參與全省電力重大建設項目的相關工作，參與電力價格制定。
宏企業管理培訓處觀指導現代企業制度建設，推進企業管理創新，推廣企業管理信息化；實施企業經營管理人員素質提升工程，制定培訓規劃及政策措施；指導和培育企業管理咨詢和培訓等中介服務機構，認定企業管理咨詢資質；指導企業智力引進工作，開展企業經營管理人員國際合作培訓與交流。
生產服務業處（掛市場拓展處牌子）。協調指導工業和信息化企業分離和發展生產性服務業工作，研究提出相關政策措施，推進制造業和服務業融合發展，推進生產性服務業功能區和公***服務平臺建設；指導企業市場拓展，監測分析重點產品市場供求狀況，並組織調控；指導企業建立完善產品市場營銷體系，組織協調工業和信息化的會展活動；指導企業積極發展科技服務業、現代物流業、國際貿易、創意產業和售後服務業等；指導地方發展總部經濟、樓宇經濟。
經濟合作處。協調與指導引進內資工作，組織開展對國家大企業大集團的招商引資；負責工業和信息化領域的經濟合作與交流工作；承擔長三角經濟合作相關工作；承擔省引進內資工作領導小組辦公室的日常工作。
機械行業管理辦公室。組織擬訂並實施機械行業產業政策、發展規劃和技術規範；做好本行業經濟運行分析和產業信息發布，協調行業發展中的重大問題和事項；組織實施行業準入，承擔船舶行業管理和車輛生產企業及產品公告管理；落實本行業淘汰落後生產能力工作；協同培育本行業大企業大集團、行業龍頭和重點骨幹企業；參與本行業重大工業建設項目投資的有關工作。
醫藥石化行業管理辦公室（掛省履行禁止化學武器公約辦公室牌子）。組織擬訂並實施醫藥石化行業產業政策、發展規劃和技術規範；做好本行業經濟運行分析和產業信息發布，協調行業發展中的重大問題和事項；組織實施行業準入；落實本行業淘汰落後生產能力工作；協同培育本行業大企業大集團、行業龍頭和重點骨幹企業；參與本行業重大工業建設項目投資的有關工作；承擔醫藥行業管理，承擔藥品、藥械儲備及緊急調度；承擔全省農藥（含衛生殺蟲劑）生產定點核準和生產批準書審核；承擔履行《禁止化學武器公約》的組織協調工作。
建材冶金煤炭行業管理辦公室。組織擬訂並實施建材、鋼鐵、有色金屬、黃金、稀土、煤炭行業產業政策、發展規劃和技術規範；做好本行業經濟運行分析和產業信息發布，協調行業發展中的重大問題和事項；組織實施行業準入；落實本行業淘汰落後生產能力工作；協同培育本行業大企業大集團、行業龍頭和重點骨幹企業；參與本行業重大工業建設項目投資的有關工作；負責煤炭生產、經營企業資質管理。
輕工紡織行業管理辦公室。組織制定並實施輕紡行業產業政策、發展規劃和技術規範；做好本行業經濟運行分析和產業信息發布，協調行業發展中的重大問題和事項；組織實施行業準入，承擔電動自行車、殘疾人輪椅車的安全技術鑒定和公告管理；落實本行業淘汰落後生產能力工作；協同培育本行業大企業大集團、行業龍頭和重點骨幹企業；參與本行業重大工業建設項目投資的有關工作；承擔傳統工藝美術保護和發展工作；承擔省繭絲綢協調辦公室的日常工作。
軍工管理處。研究起草我省發展國防科技工業的配套政策和地方性法規、規章草案並監督實施；組織協調、督促檢查國家下達的國防科技工業高新工程、專項計劃和軍品科研、生產任務的實施，並提供保障服務；組織協調武器裝備科研生產重大事項；審核報批武器裝備科研生產許可，監督管理軍品市場，承擔民用部門軍品配套工作，承擔武器裝備科研生產的安全保密資格審核、認證和監督管理工作；承擔軍品科研生產計劃、質量、計量、統計、合同確認等工作，做好軍工投資項目和軍品出口監督管理工作，協調落實軍品科研生產各項優惠政策；承擔軍工電子行業管理。
民爆器材監管處。組織擬訂並實施民爆器材行業產業政策、發展規劃和技術規範；做好行業經濟運行分析和產業信息發布，協調行業發展中的重大問題和事項；指導民爆器材行業體制改革；承擔民用爆炸物品銷售許可和銷售環節固定資產投資項目管理；承擔民用爆炸物品生產、安全生產許可和生產環節投資項目、產品質量、生產計劃的有關管理工作；承擔民爆器材生產、銷售環節的安全監管工作。
軍民結合推進處。組織指導國防科技工業的軍轉民工作，推動軍工經濟與地方經濟融合發展；實施國家有關軍民兩用技術雙向轉移、軍民通用標準體系建設等軍民結合發展規劃；指導軍民結合產業基地發展工作；承擔核能利用、衛星資源利用等軍民結合產業市場準入工作；承擔民口配套和協調整機科研工作；做好民用航空、航天、核工業的行業管理。
信息化推進處。指導全省信息化體系建設；協調指導應用信息技術改造提升傳統產業，組織實施信息技術推廣應用；指導協調電子政務發展；推進電子商務和網絡經濟發展、信息技術公***服務平臺建設等工作；承擔信息化建設市場監管，承辦信息系統集成和工程監理等資質認證；組織重大信息化項目的績效評估；協調推進集成電路卡產業發展；承擔“省金卡辦公室”、省信息化工作領導小組辦公室的日常工作。
信息安全協調處。協調我省信息安全保障體系建設；指導監督政府部門、重點行業的重要信息系統與基礎信息網絡的安全保障和安全檢查等工作；組織指導和管理信息安全等級保護、風險評估、測評等工作；承擔省信息安全應急協調工作，協調處理網絡信息安全重大事項；監督管理電子認證服務機構，協調推進數字認證體系建設與推廣應用；承擔省網絡與信息安全協調小組辦公室日常工作。
信息資源與基礎設施處。協調信息化建設中的重大問題；促進通信網、廣播電視網和計算機網絡等“多網”融合發展；承擔對信息化基礎設施固定資產投資項目的前置審核；協調重要信息系統災備工作；承擔各類臺站、管網等信息基礎設施建設的布局和站址的審批、審核。
電子信息行業管理辦公室。組織制定並實施電子信息行業產業政策、發展規劃；做好行業經濟運行分析和產業信息發布，協調行業發展中的重大問題和事項；組織實施行業準入；承擔本行業淘汰落後生產能力工作；協同培育本行業大企業大集團、行業龍頭和重點骨幹企業；參與本行業重大工業建設項目投資的有關工作；組織推進電子信息產業基地、園區和公***服務平臺建設；承擔電子信息產業統計匯總等基礎工作；承擔集成電路設計企業及產品認定工作。
軟件和信息服務業處。指導軟件業、信息服務業發展。擬訂並組織實施軟件、系統集成及服務的技術規範和標準；推動軟件公***服務體系建設；推進軟件服務外包。
無線電管理局。起草全省無線電管理地方性法規、規章草案和政策性文件，承擔轄區內除軍事系統外的無線電頻率規劃、分配與指配；依法實施無線電管理行政許可，審查無線電臺（站）的建設布局和臺址，核發電臺執照；承擔無線電監測、檢測，協調處理無線電幹擾，依法組織實施無線電管制，監管無線電臺（站）及無線電發射設備；管理全省無線電管理派出機構；承擔省無線電管理辦公室的日常工作。
中小企業綜合管理處。承擔中小企業業務綜合協調工作；負責有關中小企業工作的情況綜合等綜合性事務管理；承擔中小企業公***信息指導服務；配合落實中小企業獲得政府采購份額的有關工作。
中小企業發展規劃指導處。
組織開展對中小企業改革和發展重大問題的調查研究；提出並組織實施中小企業中長期發展規劃和年度計劃，建立中小企業培育信息庫；承擔中小企業（鄉鎮企業）相關統計和發展動態監測分析；開展中小企業法律咨詢和維權服務。
中小企業創業創新促進處。指導中小企業科技創新和國家扶持中小企業技術改造的相關工作；指導中小企業管理創新和制度創新；指導農民創業和發展農產品加工業；指導和服務農村家庭工業提高發展；推進中小企業社會化公***服務體系建設。
中小企業融資擔保處。指導和推進支持中小企業發展的投融資服務體系建設，指導協調和落實國家和省有關扶持中小企業融資擔保的相關政策措施，改善中小企業投融資環境；審批全省融資性擔保機構設立與變更，指導、監管擔保業的發展；推進中小企業信用制度和信用體系建設，完善信用征集與評價體系；指導中小企業開展產權交易，促進中小企業產權流轉；承擔省融資性擔保業務指導監管聯席會議辦公室的日常工作。
中小企業協作交流處。指導和組織中小企業開展國際合作與交流；指導中小企業與大企業開展協作配套和專業化生產；組織中小企業參加國際、國內大型展會及市場拓展活動；組織中小企業開展地區間經濟合作與交流；承擔中小企業協作交流的對外聯絡工作。
人事處。負責委機關及下屬單位的機構編制、人事管理、隊伍建設等工作；參與相關專業技術人員管理工作；協助做好作風建設、效能建設工作。
離退休幹部處。負責委機關離退休人員的管理服務工作，指導委屬單位離退休人員管理服務工作。
直屬機關黨委。負責機關和委屬單位的黨群工作。