制藥企業生產假藥要確定責任主體，具體情況具體處理，但質量副廠長是不能下線的。
目前，我國藥品監管力度加大，對生產銷售假藥行為的打擊處罰更加嚴厲，嚴重的要追究刑事責任。所以對於生產假藥的制藥企業主要負責調查取證，最後確定誰負主要責任，誰負連帶責任。
經查實，生產、銷售假藥的藥品生產企業，
按照《藥品管理法》第七十四條的規定，壹律撤銷藥品批準證明文件。其中，對使用非法化學原料藥生產、非法委托生產、已停產的涉假藥生產企業，壹律按照情節嚴重依法撤銷藥品批準證明文件，並吊銷《藥品生產許可證》；對已查證屬實的藥品經營企業出租、轉讓證照票證經營假藥，明知渠道不清或手續不全仍購進、銷售假藥等情況的，壹律按照情節輕重依法吊銷《藥品經營許可證》。吊銷《藥品經營許可證》；對生產、銷售假藥的藥品生產經營企業，壹律公開曝光。涉嫌犯罪的，壹律移送公安機關追究刑事責任。
《刑法》第壹百四十壹條規定了生產、銷售假藥罪的罪名和處罰
第壹百四十壹條 生產、銷售假藥，足以嚴重危害人體健康的，處三年以下有期徒刑或者拘役，並處或者單處銷售金額百分之五十以上二倍以下罰金；嚴重危害人體健康的，處三年以上十年以下有期徒刑。並處銷售金額百分之五十以上二倍以下罰金；致人死亡或者對人體健康造成特別嚴重危害的，處十年以上有期徒刑、無期徒刑或者死刑，並處銷售金額百分之五十以上二倍以下罰金或者沒收財產。