美國食品與藥品安全局（FDA）的分析資料顯示，壹般而言，多數罐裝淡金槍魚的汞含量只有白鮪魚（又稱長鰭金槍魚）的1/3。但針對市場出售產品的檢測發現，6%的罐裝淡金槍魚汞含量與白鮪魚的汞含量壹樣多，有些甚至還超出兩倍。少量的汞攝入，會損害孕婦和幼齡兒童的神經及行為功能，比如聽覺、手眼協調能力和學習能力。如果成年人經常食用高汞含量的魚，也會影響神經、心血管和免疫系統。建議孕婦和幼兒應謹慎或避免食用任何罐裝淡金槍魚食品。 金槍魚肉中本來就含有鉛，而在調制金槍魚的過程中工具也會帶入相應的鉛，裝罐後焊錫中的鉛更有大量滲入金槍魚肉。不使用焊錫的罐頭金槍魚肉的鉛含量達到7ug/g，而經過焊錫的罐頭鉛含量會達到700-1400ug/g。想要改善這個問題，應該改善食品加工和制造方面，禁止在罐頭上使用焊錫這項工藝，即可減少前的攝入量。再對幹燥粉碎等調理方法加以改進，可以使鉛含量進壹步減少。人體中鉛含量超標會導致人體感到頭痛、頭暈、肢體酸痛、疲倦乏力、消化不良、口中有金屬味、腹部隱痛、便秘等癥狀。少數患者牙齦緣粘膜內可見硫化鉛點狀顆粒沈積形成的“鉛線”。呈深灰色或藍色的帶狀或不規則的斑塊。 魚類的蛋白質含量比較豐富，所以更容易腐敗，海魚腐敗變質後會產生組胺，攝入後使機體發生中毒，是食品中較為重要的不安全因素。金槍魚罐頭在制作中如果含有不新鮮的原料，可能會引發組胺中毒。中毒癥狀可在攝入汙染魚類之後2h出現，病程通常持續16h，壹般沒有後遺癥，死亡也很少發生.組胺對人胃腸道和支氣管的平滑肌有興奮作用，從而導致人呼吸緊促，疼痛，惡心，嘔吐和腹瀉，這些癥狀經常伴隨神經性和皮膚的癥狀如頭痛，刺痛，發紅或蕁麻疹等
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