近年來，濫用眼藥水的現象到了比較嚴重的程度，造成了壹些不良後果。
抗生素類眼藥水：這類眼藥水主要有氯黴素、氧氟沙星、諾氟沙星、托比奧等。主要用於眼部細菌感染性疾病，如細菌性結膜炎、角膜炎等。它們也可在眼科手術前後短期使用，以預防細菌感染。但對於壹些非感染性眼病，如各種理化因素引起的慢性結膜炎（表現為輕度眼癢、眼紅、異物感、少量分泌物等）、幹眼癥（表現為眼睛幹澀、異物感等）等，則不需要使用抗生素眼藥水。如果長期使用，往往會適得其反。在正常的眼瞼、結膜囊等部位的眼球表面有多種微生物（主要是細菌，也有真菌、病毒等）定居、生長和繁殖，醫學上稱之為 "正常菌群"，它們對維持人體的生態平衡和內環境的穩定起著重要作用。如果長期濫用抗生素眼藥水，壹方面殺死了正常菌群，破壞了眼部的生態平衡，可能引發多種疾病；另壹方面使細菌對藥物產生耐藥性，等到眼部細菌感染，需要使用抗生素時，這些藥物就失效了。
激素眼藥水：這類藥物主要有可的松、科漢（確當）、碘比希、帕利巴等。它們是眼科最常用的藥物之壹，主要用於治療眼部的非感染性炎癥，如眼部手術後的炎癥、葡萄膜炎等。對於壹些感染性眼病，在使用大劑量敏感抗生素的同時，在醫生嚴密觀察下，也可少量使用。這類藥物有壹些***具有相同的特性，能降低眼部的抵抗力，使眼部細菌、病毒等感染病情加重，長期使用可能引起激素性青光眼、激素性白內障等眼病，所以這類藥物應在醫生指導下使用，每半個月檢查壹次眼壓，不能自己到藥店購買，盲目使用。
防近視眼藥水：學生學習負擔重，近視發病率持續上升是社會普遍現象，也是家長最關心的問題，因此防治近視眼藥水也很受歡迎。很多家長不惜花重金，只聽誰說哪種眼藥水好，就買來使用，結果得不償失，長期使用還會產生壹些藥物的副作用。
護眼眼藥水："電腦終端眼病 "主要表現為眼睛酸脹、幹澀、輕度異物感。當眼睛疲勞時，雖然當時滴眼藥水會有清涼的感覺，讓人感覺舒服，但這終究是治標不治本，只能暫時緩解眼睛的不適。而這種不適，只要我們在工作和學習中稍加註意，不要長時間盯著顯示器，適當休息，是可以避免和恢復視疲勞的。
在眼球表面有壹層由淚液形成的薄薄的淚膜，它對眼球表面具有滋潤、保護和營養作用。
在滴眼液的生產過程中，為了防止微生物汙染，通常需要添加防腐劑。這種防腐劑會直接損傷眼球表面的上皮細胞，眼藥水中的其他藥物成分也會改變淚膜的成分，影響淚膜的穩定性，從而影響眼球表面上皮細胞的健康。當然，這種損害是非常輕微的。同時，眼睛本身對損傷有壹定的抵抗力，所以不會在短時間內顯現出來。但是，如果長期、頻繁地使用眼藥水，比如半年、壹年甚至幾年，當這種損傷超過了眼睛自身的修復能力時，就會表現出眼睛幹澀、異物感等癥狀。有的患者因為眼睛幹澀等原因進行眼藥水治療，剛開始有效，壹段時間後沒有效果，而且癥狀越來越重，可能就是這個原因。
俗話說："是藥三分毒"。這句話雖然有些誇張，但不無道理。眼藥水雖然是眼睛局部用藥，副作用小，但畢竟是藥三分毒，最好還是在醫生的指導下合理使用。