2.學科建設上:藥理學為國家重點（培育）學科，貴陽醫學院就沒有國家重點學科。但貴陽醫學院有博士授予權（只是基礎醫學），這比遵義醫學院要好。但是在自然科學基金獲批數量上，遵義醫學院已經連續五年位居貴州省高校的第二位。（除貴州大學）
3.從辦學歷史來講:兩校都是西南地區的老牌醫學院，都是很早就獲得碩士授權點的高校，這點比瀘州醫學院強多了（瀘州醫學院前身是大專院校，去百度就知道了。）聽遵義醫學院的壹位老教授說，當時大連醫學院南遷到遵義時就有教授102人，當時貴州所有高校教授加起來還要多壹人，這足見其當時在西南地區醫學界的實力。
4.從實習點看:實習對醫學生很重要，貴陽醫學院的實習點除省 人民醫院和第壹附屬醫院以外，其余全是比較垃圾（都是位於貴州省內的）。而遵義醫學院，實習點有自己的附屬醫院（貴州省第壹家三甲醫院），貴州省人民醫院，四川省人民醫院，成都第二人民醫院，成都鐵路中心醫院，大連大學中山醫院。而珠海校區方面有中山市人民醫院，佛山市人民醫院，深圳中心醫院，東莞市人民醫院，中山大學第五附屬醫院，珠海市人民醫院，北京航天總醫院等等（廣東是中國第壹富省，醫院實力絕對比貴州的強很多倍啊。）從實習點上看貴醫就差遵醫好多。
5.學校排名:有些綜合排名貴陽醫學院較遵義醫學院高，但有些醫學排名就遵義醫學院高，個人覺得看排名沒有意義，因為兩所學校都不是重點大學（211,985），沒有用人單位在意這個，考研就更沒有了。考研除211,985外，其余學校的在妳報考的導師眼中都壹個樣。
6.從學校未來的發展上看:貴陽醫學院會升為貴州醫科大學，但是遵義醫學院也是肯定會獲得博士點（已經獲得省的博士立項）並升為遵義醫科大學的。但是從長遠看，遵義醫學院在珠海也有其校區（西部唯壹壹所在發達地區擁有醫學院的高校），假以時日遵義醫學院必定發展為西南和華南地區，乃至整個南中國的壹所醫學名校。