藍藻又稱藍綠藻，是壹種大型單細胞原核生物，進化歷史悠久，革蘭氏染色陰性，無鞭毛，有葉綠素a，但無葉綠體(不同於真核生物的藻類)，能進行產氧光合作用。
與光合細菌不同，光合細菌(Rhodosporus)進行的是原始的光合磷酸化，在反應過程中是厭氧生物，不釋放氧氣，而藍藻可以進行光合作用，釋放氧氣。它的發展使整個地球的大氣從無氧狀態發展到有氧狀態，從而孕育了所有有氧生物的進化和發展。
當藍藻大量出現時，附近水體壹般呈藍色或綠色，水面被厚厚的藍綠色湖靛覆蓋，被風吹到岸邊堆積。不僅含有毒素的藍藻細胞會漂浮在水體中，而且當它們與壹些懸浮物絡合或被養殖物捕食時，會與其排泄物壹起沈澱，堆積在魚塘底部，對無公害水產品的生產產生巨大的負面影響。
藍藻中的衣藻能迅速產生致死因子，破壞養殖對象的鰓組織，幹擾正常代謝，麻痹神經，使其死亡。藍藻中的個體物種不僅在活體中攜帶毒素，還會分解死亡的個體產生生物毒素——藍藻毒素。
藍藻簡介:
藍細菌紅球藻呈球形和半球形。通常，由2、4、8、16或更多細胞(很少超過64或128細胞)組成的群體是罕見的。每個細胞都含有均勻或不規則的小顆粒。假液泡要麽存在，要麽不存在。細胞色素區的顏色為白灰色至淡藍綠色、藍綠色、橄欖綠、橙黃色或藍紫色。
每壹個細胞都被具有均勻紋理和分層的個體鞘所包圍，從而與群體中的每壹個細胞相分離；群體的膠質鞘因含有大量水分而厚、均勻或分層、堅實或脆弱而透明。有三個細胞分裂平面。在兩個細胞相連的地方，群體中的壹些細胞有時是平的和有角的，因此細胞通常是半球形的。常見的種類有湖色球菌、限制色球菌、微小色球菌和微小色球菌。