因許多兒童仍然在生長，所以目標設置和治療必須是個體化的（即采取適合不同肥胖兒童的治療方法）。首要目的是恢復能量攝入和消耗的平衡；在攝入顯然過多的情況下，在增加能量消耗的同時必須限定熱量攝入。
穩定生長中兒童的體重可緩慢降低 BMI Z分值。不過，成年人的研究提示，以0.5kg/周的速度，體重減少5~10%，保持2~5年，可增加胰島素的敏感性，改善葡萄糖耐受性。因此，應當以BMI Z分值的減少鼓勵肥胖兒童。兒童期肥胖治療的長期目標是將BMI Z分值降低到2以下，逆轉和預防短期和長期的***存疾病。 少兒肥胖可分為乳兒肥胖、幼兒肥胖、學童肥胖、青春期肥胖。從小兒最容易發胖的年齡來說,可有兩個時期:壹是脂肪組織發育最旺盛的乳兒期,壹是青春前期。
乳兒期是以脂肪細胞數增殖為主並伴有肥大。青春期與之相反,脂肪細胞以肥大為主伴有增殖。從乳兒期肥胖伴有脂肪細胞增殖這壹點來說,可以知道其多少與後來的肥胖有關。當然, 也有自然減輕的事例。所以,乳兒期的肥胖也可看作良性肥胖。約有70%～80%的學童期肥胖、青春前期肥胖會發展為成年肥胖。因此,兒童減肥應從幼兒期開始。 隨著“減肥”風的刮起，運動減肥已成為近年來醫務工作者及廣大肥胖患者普遍推崇的減肥方法，認為這種減肥方法有“百益而無壹害”。因此，兒童選擇運動減肥也是可行的。
日本學者認為，體育療法可以加強患兒的能量消耗，促進基礎代謝的提高和改善脂肪的氧化，運動療法和飲食療法的相互配合可發揮明顯效果，而單用運動療法使體重減少是非常困難的，特別是小兒更為困難。
那麽，兒童肥胖怎樣行使運動療法好呢?
壹般來說，應嚴格地掌握循序漸進的原則，象食物療法壹樣分階段進行。不能要求肥胖癥患兒從不愛活動的生活方式立即改變到強度較大的體耗狀態，這是絕對禁止的。
其次，小兒的體育療法也應該在醫生指導下進行，絕對不能自作主張。因為不合理的體療會使心血管系統和植物神經系統功能進壹步失調,其結果是不但不能減肥，而且容易引起危害性的並發癥。
在各種體療項目中，可以偏重些不以雙足為支撐點的內容，如坐著或躺著做操，遊泳、劃船、騎自行車，以及溜冰、郊遊，大壹點的孩子可以要求其每日堅持跑步鍛煉。不過，壹定要擬定壹個綜合性的鍛煉計劃，並經醫生許可。
除上述外，在肥胖兒的日常生活中把掃除、疊鋪被褥、涮洗餐具等作為身體活動的壹項內容，這也是肥胖兒運動療法較為適合的方法。
總之，只要合理行使運動療法，是能收到較好療效的。不要因為運動的結果，孩子的食欲增加，就任其多吃主食，運動療法要與飲食療法相配合，如定時就餐，少吃零食，喝些含豐富維生素的飲料，細嚼慢咽等，只有兩者有機的結合起來，運動減肥方能見效。 心理治療方法對於兒童來說,有時比飲食和藥物治療更見效。因為兒童的心理正處於調整適應階段,通過有效的心理調整,完全可以改變兒童的不良飲食習慣。
兒童肥胖的心理治療,可采用以下方法：
(1)進行肥胖病知識的教育 通過舉辦兒童夏令營的形式,請有關專家講解肥胖病的知識,提高兒童對肥胖病產生後果的認識,使兒童能夠自覺自願地接受減肥治療。
(2)教會孩子科學的飲食習慣 告訴孩子不要過快的進食,實行定點定時進餐,減少零食。
(3)鼓勵孩子多參加運動 教育孩子不要進食後就睡覺,不要在看電視時進餐,進食後要適當活動。
(4)鼓勵孩子克服自卑心理 有時由於身體肥胖經常受到同伴的譏諷,此時應鼓勵孩子面對現實,積極主動地參與減肥。壹旦有效就應鼓勵他們堅持下去。
(5)幫助孩子建立行為減肥方案。 如果生活方式幹涉失敗，應由專科醫師進行評價。專科醫師應評估***存疾病的範圍和程度，考慮包括藥物的治療方法。當前，以增加能量消耗（刺激）、抑制熱量攝入（抑制食欲）、限制營養素吸收和/或調解胰島素生成或作用來設計藥物幹涉。
刺激性藥物 使用代謝刺激劑治療肥胖在歷史上發生過許多波折。曾經認為許多抗肥胖藥物是安全和有效的，即甲狀腺激素、二硝基苯酚（dinitrophenol）、安非他明（amphetamine）、氟苯丙胺（fenfluramine）、右旋芬氟拉明（dexfenfluramine）、苯丙醇胺（phenylpropanolamine）、麻黃類（ephedra），後來因為這些藥物比較危險，在某些情況下引起危及生命的並發癥而放棄使用。
在攝取適度低熱量飲食的青少年的壹項短期實驗中，將咖啡因加麻黃素與安慰劑進行了比較，雖然藥物治療受試者減去了更多的體重，但副作用過多。因此，不能推薦這些藥物。
抑制食欲的藥物 目前唯壹批準肥胖青少年（16歲以上）使用的抑制食欲的藥物是西布曲明（sibutramine）結合熱量限制和全面家庭行為計劃，在最初的6個月期間，西布曲明使43名肥胖青少年BMI減小了8.5±6.8%，而39名安慰劑處理的受試者減少了4.0±5.4%。在後來6個月的治療中，體重未再減少。但以西布曲明治療的43名受試者中的19名出現了輕微的高血壓和心動過速，迫使減少了藥物劑量，其中5名血壓持續升高而終止了藥物應用。其它潛在的嚴重並發癥包括失眠、焦慮、頭疼和抑郁。
抑制食欲藥物應當是飲食和運動計劃的補充，決不能替代飲食調節和運動。這些藥物對於總體重有適中的作用，在個體之間的反應存在相當大的差異。應用抑制食欲藥物可在開始治療後4－6個月達到最大效果，但停止用藥後體將恢復。建議這種藥物的使用持續時間不超過2年。
對遺傳性瘦素缺乏兒童給以瘦素治療導致體重顯著下降。但值得懷疑的是，非瘦素缺乏的肥胖形式是否能夠通過類似的治療取得效果。
已有兩項關於甲福明應用於胰島素抵抗、正常葡萄糖耐受性和2型糖尿病陽性家庭史肥胖青少年的隨機化、雙盲、安慰劑對照研究。在第壹項實驗研究（n=29）中，在無飲食幹涉的情況下，甲福明降低了BMI Z分值（3.6%，相對於安慰劑對照組）。在第二項試驗（n=24）中，相對於對照組來說，甲福明與低熱量飲食壹起降低體重2.7%，降低了血漿瘦素、胰島素、葡萄糖、膽固醇和甘油三酯濃度。
總體上講，甲福明很好忍受，雖然許多病人有暫時的腹部不適感，但隨食物壹起服用藥物可以避免不適。在兒科病人，乳酸過多癥非常少見，但對於心、肝、腎和腸胃道潛在疾病的兒童不能應用甲福明。肝臟酶輕微升高（正常標準3倍以下）的肥胖受試者可接受這種藥物。某些研究的確提示，甲福明可能有助於治療肝臟脂肪變性。甲福明已被食品和藥物管理局批準治療T2DM，但目前尚未批準用於兒童肥胖和胰島素抵抗的治療。
奧曲肽（octreotide） 奧曲肽與生長激素抑制素-5受體結合，因此消弱了β細胞鈣通道的關閉，減少依賴葡萄糖的胰島素分泌。在下丘腦性肥胖兒童的雙盲、安慰劑對照研究中，奧曲肽減少胰島素的分泌性反應，降低體重 (+1.6±0.6對+9.2±1.5 kg)和BMI（－0.2±0.2對+2.3±0.5 kg/m2）的增長速度。藥物的成本、非腸道處理、以及藥物的副作用:包括短暫的胃腸不適、膽結石、GH(生長激素)和TSH分泌的抑制和心臟功能障礙，限制了這種藥物在下丘腦損傷引起的難以處理的肥胖病人中的可應用性。 對於嚴重肥胖的患者，生活方式幹涉和藥物治療的長期有效性通常是令人失望的。體重顯著下降非常少見、很少持久，而且普遍出現代謝和血管並發癥。對於極端肥胖和嚴重***存疾病可能需要更強烈的治療方法，例如肥胖癥外科手術治療。現在最普遍使用的外科手術方法是腹腔鏡胃捆紮帶方法（laparoscopic gastric banding procedure）和胃腸轉流方法(Roux-en-Y gastric bypass, RYGB)。胃捆紮帶可能引起食道擴張和失弛緩癥，並可能惡化胃食管反流。其它潛在的並發癥包括穿刺口位置不正、充氣囊破裂和感染。最嚴重的並發癥是潛在的致命的肺栓塞。RYGB的死亡率在1~5%。如果由有經驗的外科醫生通過腹腔鏡完成手術，可減少並發癥。發表的關於青少年外科手術實驗文獻相對較少，但其結果可能與成年人肥胖手術治療相似，應當進壹步研究。