預防接種異常反應調查診斷工作按照衛生部規定和《預防接種工作規範》執行。
因接種單位違反預防接種工作規範、免疫程序、疫苗使用指南、接種方案等造成受種者損害，需要進行醫療事故技術鑒定的，按照醫療事故技術鑒定的規定執行。
因疫苗質量或者疫苗檢驗結果引起的爭議，依照《藥品管理法》的規定，向藥品監督管理部門提出處理意見。第四條 預防接種異常反應鑒定應當遵循公開、公正的原則，堅持實事求是的科學態度，做到事實清楚，定性準確。第五條 預防接種異常反應鑒定工作由市級和省、自治區、直轄市醫學會負責。第二章 鑒定專家庫 第六條 省、自治區、直轄市醫學會建立預防接種異常反應鑒定專家庫，為省、市級醫學會提供預防接種異常反應鑒定專家。專家庫由臨床、流行病學、醫學檢驗、藥學、法醫學等相關學科專家組成，並依據相關學科成立專業組。
醫學會可以根據預防接種異常反應鑒定的實際情況，對專家庫的學科專業組予以適當增減，對專家庫成員進行調整。第七條具備以下條件的醫藥衛生等專業技術人員可以作為專家庫人選：
（壹）具有良好的業務素質和執業道德；
（二）受聘於醫藥衛生事業單位或者醫藥衛生教學、科研等機構並擔任相應專業高級技術職務3年以上；
（三）流行病學專家應當具有3年以上免疫預防相關工作經歷；藥學專家應當具有3年以上疫苗相關工作經歷；
（四）健康狀況能夠勝任預防接種異常反應鑒定工作。
符合前款第（壹）、（四）項規定條件，並具備高級技術職務任職資格的法醫，可以受聘進入專家庫。
省、自治區、直轄市醫學會原則上聘請本行政區域內的專家進入專家庫；當本行政區域內的專家不能滿足建立專家庫的需要時，可以聘請本行政區域外的專家進入專家庫。第八條醫藥衛生事業單位或者醫藥衛生教學、科研機構、醫藥衛生專業學會應當按照醫學會的要求，推薦專家庫人選；符合條件的個人經本單位同意，也可以直接向組建專家庫的醫學會申請進入專家庫。
醫學會對專家庫成員人選進行審核。審核合格的，予以聘任，並向中華醫學會頒發統壹格式的聘書和文件。第九條 專家庫成員聘期為四年。聘期內有下列情形之壹的，由醫學會根據實際情況及時調整：
（壹）因健康原因不能勝任預防接種異常反應鑒定工作的；
（二）更換工作單位或被辭退的；
（三）不具有完全民事行為能力的；
（四）受到刑事處罰的；
（五）違反專家庫工作規定的；
（六）專家庫成員由中華醫學會根據實際情況聘任。p>（五）違反評審工作紀律，情節嚴重的；
（六）省級以上衛生行政部門和藥品監督管理部門規定的其他情形。
聘用期滿需要繼續聘用的，由原醫學會重新考核聘用。第三章 申請與受理 第十條 各級各類醫療機構、疾病預防控制機構和接種單位及其工作人員在履行職責中發現預防接種異常反應、疑似預防接種異常反應或者接到相關報告後，應當及時向縣級衛生行政部門、藥品監督管理部門報告。第十壹條 省、市、縣級疾病預防控制機構應當成立預防接種異常反應調查診斷專家組，負責預防接種異常反應的調查診斷工作。調查診斷專家組由流行病學、臨床醫學、藥理學等方面的專家組成。
縣級衛生行政部門、藥品監督管理部門接到疑似預防接種異常反應報告後，需要調查診斷的，向縣級疾病預防控制機構報告，由縣級疾病預防控制機構組織專家進行調查診斷。
有下列情形之壹的，由市級或者省級預防接種異常反應調查診斷專家組進行調查診斷：
（壹）受種者死亡、嚴重殘疾的；
（二）群體性疑似預防接種異常反應的；
（三）在社會上造成重大影響的疑似預防接種異常反應。