根據歐洲地球科學聯盟研究，世界上幾乎每條河流都有藥物汙染的情況，而在臺灣，汙染最多來源的是荷爾蒙藥物、抗生素跟心律不整、降血壓的藥物，河川中可以測到大量的雌激素，導致生物變種或死亡。在大量的環境汙染下，抗藥性的細菌產生、改變人體的荷爾蒙，已經變成用藥的風險。
藥品使用太「浪費」
健保署長李伯璋說，藥物的健保支出年年增加，如果要減少支出，會從「重復領藥不給付」先下手，因為很多人會在找不到藥的時候，又跑去醫院或藥局重領壹份。
而多出來沒吃完的藥，不只讓健保負擔增加，民眾習慣隨手丟，也讓環境汙染問題嚴重。根據根據衛福部統計， 2017年全臺醫學中心、區域醫院1年回收的廢棄藥品達到193公噸，不只讓2千多個回收站大增負擔，而沒有被回收的藥品就全部都是「汙染」。
要杜絕藥物汙染的問題，有2個面向， 壹個是減量用藥，壹個是正確回收 ，藥師公會表示，民眾如果有還沒吃完的藥、只要在有效期限內，都可以跟醫師表明不用再開那麽多的藥，免得越積越多、最後通通丟掉，變成浪費跟汙染。
超級細菌是「汙染」來的
大部份的藥物都可以丟到壹般垃圾，像是感冒藥、胃藥等，原因是臺灣的焚化爐達到攝氏850度以上，符合焚化藥品的標準，但丟棄的時候必須密封好， 不可以因為是壹般垃圾，就也隨手亂丟、甚至倒進水槽、沖進馬桶中，因為藥物的汙染並不是汙水處理廠可以處理的。
藥丸、藥錠、膠囊
先去除包裝如罐子、排裝鋁箔，跟其他垃圾混合裝在密封袋裏，包裝清洗過後，將清洗的水倒進密封袋中壹起封好，密封袋丟到垃圾車，包裝則依回收、壹般垃圾的規範分類丟棄。
藥水、藥膏
將藥水、藥膏倒進密封袋，並放入衛生紙、茶葉渣、咖啡渣等吸水物質混合，包裝用清水沖洗後，將清洗的水倒進密封袋壹起封好，丟進垃圾車，包裝則依垃圾分類的規範丟棄。
而針對 抗腫瘤藥物如標靶藥物、荷爾蒙藥物如黃體素、雌激素、避孕藥等，還有常見的抗生素、免疫抑制劑及管制藥品如 *** 、精神科用藥、限醫師使用的藥物等，都不能丟壹般垃圾，必須拿到廢棄藥品回收的地方， 如果不清楚回收的地點，可以詢問原本開藥的診所或是醫院的藥物咨詢室。
抗生素、標靶藥物等，會造成環境中的細菌產生抗藥性，變成現階段藥物無法殺死的「超級細菌」，而荷爾蒙藥物會改變環境中的荷爾蒙，幹擾生物的內分泌； *** 、精神科用藥也會造成環境荷爾蒙改變，可能誘發癌癥或造成死亡。