壹是土壤問題導致的大蔥根腐
在同壹塊地裏種植大蔥或百合科作物多年，這類作物對養分的需求是有偏差的，長此以往會造成壹些養分缺乏，再加上不合理的施肥和田間管理，造成土壤板結、酸化等壹系列問題，也就是我們所說的連作障礙或連作障礙。
防治措施:輪作種植，復施優質腐熟農家肥或商品有機肥，有條件的話，加壹些生物菌肥改良土壤，可以改良土壤，自然減少根部病害。
二是病蟲害引起的大蔥根腐病
病蟲害引起的大蔥根腐病主要有根腐病、軟腐病、根蛆病等。
1.根腐病引起的大蔥根腐病
根腐病是壹種真菌疾病，土壤和種子都可能攜帶病菌。連作是引起大蔥根腐病的主要因素，在高溫多雨的條件下，可能會引起根腐病的發生和蔓延。
①大蔥根腐病的癥狀
根腐病主要危害大蔥幼苗，成年期也可發生。發病初期，側根和須根首先發育，隨著病情的加重，會逐漸向主根擴展。發病初期無明顯癥狀，但隨著根腐病的加重，新葉出現黃色癥狀，後期全葉變黃枯萎，根皮變褐直至腐爛，最後全株無臭味死亡。
②根腐病的防治措施
與非洋蔥和大蒜蔬菜輪換；雨後註意及時排水；用甲霜靈錳鋅填根，然後培土。培土後，如發現病株，應及時開壟，用普利克或惡黴靈灌根2~3次。
2.軟腐引起的爛根
大蔥軟腐病是壹種細菌性病害，在連作、地勢較低、植物長勢過旺、地下害蟲嚴重的土地上，遇到高溫高濕時更為嚴重。
①大蔥軟腐病的癥狀
大蔥軟腐病多發生在鱗莖膨大期。在發病初期，感染通常從假莖基部根蛆造成的傷口開始，患病部位浸水腐爛，半透明，部分病株假莖腐爛，有橙紅色氣味，可觀察到骯臟的白色細菌溢出，葉片扭曲，植株倒伏。
②軟腐病的防治措施
建立輪換制度，減少致病菌的積累；對連年病害嚴重的地塊，每畝可噴生石灰50公斤或1~2公斤地松，對土壤進行消毒；在發病初期，可噴灑kocide或硫酸鏈黴素。噴施時要註意噴基，或用上述藥劑灌根，每隔7~10天1次，連續2~3次。
3.洋蔥蒼蠅引起的爛根
蔥蠅又叫種蠅，其幼蟲又叫根蛆或地蛆，是壹種害蟲。
①、洋蔥蒼蠅引起根腐病的癥狀。
先傷害根系，再吃假莖。根蛆為害後，凹凸不平，腐爛發臭，導致葉片發黃，整株停止生長，甚至死亡。它們更喜歡未成熟的肥料和腐爛的洋蔥和大蒜。
(二)、洋蔥防蠅措施
施用充分腐熟的有機肥；幼蟲危害嚴重的田塊，可以抑制根蛆的活動，或者通過淹水淹死部分幼蟲；收獲後，有些蟲蛹在冬天犁地時被凍死；洋蔥苗種植前，用辛硫磷蘸根，蘸根時保證藥液淹沒根部30分鐘，然後取出晾幹種植；對於有蟲害的田地，可用辛硫磷、甲基異柳磷或溴氰菊酯灌根。
三是田間管理不當造成的爛根
田間管理不當主要是由於土壤積水或漫灌後高溫天氣導致大蔥根系生理性病害。
(1)、大蔥漚根的癥狀
漚制根部後，大蔥根莖內組織變褐腐爛，根系逐漸死亡，地上部分出現幹尖黃葉，繼而萎縮，最終導致大蔥死苗死樹。
(2)大蔥漚制的預防措施。
選擇地勢高的地塊，便於排灌；雨後註意排水，嚴禁漫灌；對於根系輕度漚制的地塊，應及時中耕，增加土壤通透性，待新根長出後轉入正常管理。
從大蔥根腐病的成因可以看出，雖然造成大蔥根腐病的因素很多，但是每壹種根腐病的癥狀都是不壹樣的。因此，根腐病發生後，要結合種植管理方法和根腐病的癥狀，找出問題的原因，再實施防治措施。