2.局部抗菌藥物:洗必泰漱口液、金黴素軟膏、慶大黴素膜劑。
3.外用皮質類固醇:氫化可的松或曲安奈德膜劑、倍氯米松含漱劑或噴霧劑等。
4.局部鎮痛藥:芐達明含漱液或噴霧劑、局部麻醉凝膠等。
5.其他局部抗炎制劑:色甘酸鈉止咳糖漿、前列腺素E2膠、局部粒細胞-巨噬細胞刺激因子、阿司匹林漱口液、雙氯芬酸和sucraifate。
6.全身用藥:潑尼松龍、硫唑嘌呤、左旋咪唑、秋水仙堿、己酮可可堿、氨苯碸、西咪替丁、轉移因子等。
7.壹些中藥:西瓜霜、蜂膠等。所有患者均采用清熱瀉火法治療口腔潰瘍，其中以滴丸止痛效果最為明顯。臨床研究表明，首次用藥後最短起效時間為3分鐘，最長為15分鐘，平均起效時間為5.67分鐘。即時緩解自發性疼痛癥狀效果好，5分鐘即可緩解。
8.局部治療:維生素c。
9.中醫治療:清揚散是治療口腔潰瘍的中藥。具有清熱解毒、降火、消炎止痛的功效。
關於“全身治療”:反復發作或有嚴重潰瘍癥狀者，應全身用藥。可以使用皮質類固醇潑尼松龍，也可以與咪唑硫嘌呤合用，但要註意其副作用。也可使用抗腫瘤壞死因子α藥物:必通，0.4g，每日3次，副作用為胃腸不適。秋水仙堿可以減輕疼痛，縮短發作頻率。其機制可能是降低中性粒細胞的趨化功能。副作用包括腸胃不適和腹瀉，長期使用會導致男性不育。有報道稱左旋咪唑與中藥合用可減少潰瘍次數，減少復發，延長間隔時間。
關於“中醫治療”:用於陰虛火旺引起的口瘡灼痛，復發性口腔潰瘍，有滋陰降火的功效。毒副作用更小。重癥患者第壹次服用兩次，壹般含在口中幾分鐘，效果較好。可以按照四診八類進行辨證論治。脾胃伏火型宜清熱瀉火，涼血通便，用葛亮散、衛青散、玉女煎等。心火上炎型，宜清心涼血利水，方藥以導赤散、瀉心湯、小薺子飲加減。對於肝郁積熱型，宜清肝瀉火，理氣涼血，方劑為龍膽瀉肝湯、小柴胡湯。陰虛火旺型宜養陰清熱，方劑宜用六味地黃湯、杞菊地黃湯、甘露湯等。脾虛濕困型宜健脾祛濕，方劑有健脾史聖湯、五泉散、魏萍散。氣血兩虛宜氣血雙補，可用補中益氣湯、沈淩白術散等。