有研究結果表明，病牛最易感染的部位是:腦、脊髓、腦脊液和眼球；傳染性較低的有:小腸、背根神經節、骨髓、肺、肝、腎、脾、胎盤和淋巴結；非傳染性:肌肉、牛奶、血液、胰腺、心臟、脂肪。
目前，瘋牛病可能有以下幾種傳播途徑:
醫源性感染
比如，輸入了感染瘋牛病患者的血液；感染瘋牛病患者的移植器官和生物制品；使用不潔醫療器械的；腦外科等。用於治療侏儒癥的垂體生長激素和用於治療不孕癥的性腺激素是從大量屍體中提取的。如果其中壹具屍體是克雅氏病，這些產品就會被汙染。
牛源藥物
用病牛的大腦、脊髓、血液、骨膠制成的藥物可以感染瘋牛病。
食用感染了瘋牛病的牛肉和牛肉制品
因為小屠宰場在屠宰牛的時候往往會剖開牛的大腦和脊髓，患瘋牛病的牛的這些物質會汙染牛的其他組織，使傳染源在牛的其他部位擴散，人吃了受感染的牛肉就會感染瘋牛病。殺完動物後，屠夫用抹布擦拭刀和案板，也擴大了傳染源。