1.抗菌療法
通過前列腺液培養發現已知的尿路致病病原體，是選擇抗菌藥物治療的基礎。如果在泌尿生殖道內發現罕見的病原體或細菌，則不能認定為致病病原體。如果非細菌性前列腺炎患者出現細菌感染跡象，壹般治療無效，也適合使用抗菌藥物。在抗菌藥物的選擇上，要註意在前列腺腺泡和微循環之間存在由脂膜構成的前列腺-血屏障，阻礙了水溶性抗生素的通過，使治療效果大大降低。有些細菌會分泌糖蛋白基質，阻止抗生素接近細菌。當有前列腺結石時，結石會成為細菌的避難所。以上因素構成了慢性細菌性前列腺炎治療的難點，需要較長的療程，且易復發。
過去常用的藥物，如復方磺胺甲惡唑(SMZ-TMP)，抗菌譜廣，但不能集中在前列腺，連續用藥兩個月後療效仍不理想。目前提倡口服氧氟沙星或左氧氟沙星等喹諾酮類藥物。如果無效，繼續使用8周。復發和壹脈相承，用預防劑量減少急性發作，減輕癥狀。如果長期使用抗生素誘發嚴重的副作用，如偽膜性腸炎、腹瀉和腸道耐藥菌株的生長，就要改變治療方案。另壹個方案是先用四環素，如果癥狀減輕，再延長到28天，如果癥狀沒有減輕，就改用喹諾酮類。
非細菌性前列腺炎是否適合用抗菌藥物治療，臨床上仍有爭議。有證據表明，過去使用喹諾酮類藥物的患者在前列腺液或前列腺按摩後，尿液培養出現假陰性結果。沙眼衣原體和支原體可引起前列腺炎，但普通培養不會有陽性結果。此外，對於有前列腺癥狀的患者，大約40%的患者在壹個療程的抗生素治療後可以獲得療效。因此，“無菌性”前列腺炎患者也適合使用對細菌和支原體有效的藥物，如喹諾酮類、SMZ-TMP或單用TMP，與四環素和喹諾酮類聯合使用或間隔使用。如果抗生素治療無效，確診患者為無菌性前列腺炎，將停止抗生素治療。
前列腺內註射廣譜抗生素可立即提高前列腺內藥物濃度，消除細菌，縮短療程。壹些作者認為它可能導致肉芽腫。Yamamoto等人在直腸前前列腺內註射阿米卡星和頭孢唑啉與1%利多卡因。註射1 ~ 2次後，超過1年，56%的人前列腺液培養轉陰。Baert等人經會陰向前列腺內註射慶大黴素和頭孢唑啉。如果細菌在第壹次註射後2 ~ 4個月仍在前列腺液中生長，則註射1次。發現71%患者癥狀消失至少6個月，部分患者需要多次註射才能維持長期療效。患者取仰臥位，屈膝，臀部，外展腿姿勢，穿刺部位選在會陰中線或稍偏側，沿軀幹縱軸距肛門65438±0cm處。針尖穿過中央會陰腱後，阻力急劇下降，然後進入前列腺感覺很堅韌。註射部位應在前列腺外周帶，穿刺部位不要靠近前方，以免過於靠近尿道，引起尿頻、血尿，也不要註射到精囊太深，以免引起血精。註射前應告知患者，如果上述情況正常，尿頻、血尿、血精癥狀會在1 ~ 2天內自動消失，不留後遺癥。註射時應使用7號針，用利多卡因或普魯卡因稀釋，註射前應進行吸引。如果有血液回流，就要調整插入深度。前列腺內藥物註射壹般每周1次，藥物在前列腺囊泡內滯留時間較長，註射1周後其濃度仍有抗菌作用。下次註射前宜晚射精，以達到最佳治療效果。這種療法對有明顯內毒素癥狀的細菌性前列腺炎患者往往能取得明顯療效，有時在註射1後第二天癥狀已明顯減輕。
也可以通過用雙氣囊導管密封前列腺尿道並將抗生素溶液從尿道腔註射到前列腺管中來實現治療。
2.消炎止痛
非甾體抗炎藥可改善癥狀，消炎痛壹般口服或栓劑使用，中藥配合消炎、清熱、解毒、軟堅類藥物也取得了壹定效果。別嘌呤醇可降低全身和前列腺液中的尿酸濃度。理論上，別嘌呤醇作為自由基清除劑，還可以清除活性氧成分，減輕炎癥，緩解疼痛。這是壹種可選的輔助療法。
3.理療
前列腺按摩可以排空前列腺管內的濃縮分泌物，引流腺體阻塞區域的感染病竈，所以對於頑固的病例，可以在使用抗生素的同時，每3 ~ 7天做壹次前列腺按摩。采用微波、射頻、超短波、中波、熱水坐浴等多種物理因子進行前列腺理療，有利於放松前列腺、後尿道平滑肌、盆底肌，加強抗菌作用，緩解疼痛癥狀。
4.α受體拮抗劑
前列腺痛、細菌性或非細菌性前列腺炎患者的前列腺、膀胱頸和尿道的平滑肌張力增加。排尿時，後尿道內壓升高，使尿液回流到前列腺管內，是引起前列腺疼痛、前列腺結石、細菌性前列腺炎的重要原因。α受體拮抗劑的應用能有效改善前列腺疼痛和排尿癥狀，對防止感染復發具有重要意義。常用藥物有阿夫唑嗪、特拉唑嗪、坦索羅辛或鹽酸酚芐明。α受體拮抗劑應長期使用，以便有足夠的時間調整平滑肌功能，鞏固療效。
5.外科療法
以前提倡根治性經尿道前列腺切除術，需要切除前列腺周圍的組織才能達到治療目的，而且容易引起出血、尿失禁、陽痿等並發癥，後來被放棄了。有明顯後尿道刺激或終末血尿的患者，經尿道鏡檢查發現膀胱頸及後尿道有假息肉、肉芽、粘膜充血、絨毛樣病變，經淺表電灼後癥狀可改善。膀胱頸痙攣和尿道狹窄患者在清除梗阻性病變後，前列腺炎癥狀可得到緩解。老年前列腺增生患者，尤其是前列腺結石患者或反復尿路感染患者，往往可以同時取出全部或大部分結石，解除梗阻，減少前列腺炎的發病。但應告知患者，慢性炎癥的腺體位於外周帶，是手術後遺留的手術囊，術後仍有可能復發前列腺炎。