出蛋殼後不久即死亡的雛鴨出現蛋黃吸收不良、臍部炎癥、腸粘膜卡他性或出血性炎癥、肝臟輕度腫大、瘀血等癥狀。在較大年齡死亡的雛鴨具有腫脹和充血的肝臟，並且在表面上具有小的灰黃色壞死病竈。膽囊腫大，囊內有大量粘稠的膽汁。脾臟也明顯腫脹斑駁。小腸後段和直腸腫脹，腸黏膜呈卡他性或出血性炎癥。典型病變為盲腸腫大1 ~ 2倍，腸內有雜色花紋和奶酪樣腫塊。其他病理變化包括心包炎、心包積液和心外膜出血。腎臟呈白色，含有尿酸鹽。氣囊混濁，常有黃白色纖維素。有時會出現肺炎、肺水腫、腹膜炎、卵巢炎等癥狀。
根據雛鴨死亡多的事實，臨床診斷表現為腹瀉嚴重，糞便腥臭，糞便粘連在泄殖腔周圍絨毛內，顫抖和運動障礙，最後常因抽搐和角弓內翻而死亡。屍檢的特征是盲腸腫脹、壞死性腸炎和幹酪樣腸內容物。由於沙門氏菌在自然界分布廣泛，鴨的癥狀和病理變化與其他疾病非常相似，因此臨床上很難對鴨沙門氏菌進行診斷。診斷需要通過細菌學檢查，先分離培養細菌，再通過凝集試驗和生化試驗鑒定沙門氏菌。
由於鴨沙門氏菌血清型復雜，目前預防鴨沙門氏菌病的疫苗效果不佳。采取以下綜合預防措施會收到良好的效果:
(1)防止蛋殼汙染，保持產蛋箱清潔衛生，勤消毒，勤換墊草，每天定時撿蛋，做到箱內無蛋。雞蛋每天及時分揀、消毒、入庫。卵庫的溫度保持在65438±02℃，相對濕度為75%。孵化前對蛋消毒1次。保溫箱、孵化器的衛生、消毒、防疫工作尤為重要，要制定相應的制度，不讓閑人進入，做到室內無病毒、無病原體。
(2)為防止雛鴨感染運送鴨子的容器和車輛，應進行嚴格消毒。進入育雛房前，地面、空間、草席都要徹底消毒。在雛鴨的飼料和飲水中添加適量的抗菌藥物。消滅老鼠、蚊子、蒼蠅，防止麻雀等鳥類進入育雛舍。
(3)加強雛鴨的飼養管理。育雛室內要墊上幹燥幹凈的床墊，要有足夠的飲水機和水槽。室內溫度應在1周內維持在28 ~ 30℃，以後每增加1周，室內溫度下降2℃。禁止將雛鴨與成鴨或中鴨同欄飼養。冬季註意防寒保暖，夏季避免屋內淋雨，防潮防潮。
土黴素、地菌凈和氟喹諾酮類藥物(環丙沙星、恩諾沙星和氧氟沙星)對鴨沙門氏菌有較好的治療效果。在鴨病情較輕、食欲正常的情況下，可選用1 ~ 2藥物，按治療劑量摻入飼料中，3 ~ 5天或5 ~ 7天為壹個療程。如土黴素粉，按0.06% ~ 0.65438±0%的比例飼餵，飼餵5 ~ 7天。在繼發細菌感染的情況下，應考慮對革蘭氏陰性菌和革蘭氏陽性菌敏感的藥物聯合用藥。