雖然口腔潰瘍的確切病因尚不完全清楚，但大多數學者認為口腔潰瘍的發生是多種因素綜合作用的結果。免疫、遺傳和環境可能是口腔潰瘍的“三重因素”，即遺傳背景和適宜的環境因素(包括精神神經體質、心理行為狀態、生活工作、社會環境等。)可引發異常免疫反應，引起口腔潰瘍的特征性病變。也有人提出“二元因素”理論，即外源性因素(病毒、細菌)和內源性誘發因素(激素變化、精神心理因素、營養缺乏、全身性疾病和免疫功能障礙)相互作用而致病。大多數醫生認為口腔潰瘍與以下因素有關:
1，消化系統疾病和功能障礙
系統性疾病患者容易發生口腔潰瘍，主要是通過影響免疫系統。口腔潰瘍與胃潰瘍、十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎、局限性腸炎、肝炎有關。研究表明，30%-48%的口腔潰瘍患者患有消化道疾病，如腹脹、腹瀉或便秘。其中9%以上有消化道潰瘍。
2.內分泌變化
部分女性患者常發生在月經期，可能與體內雌激素減少有關。有些女性在每個月經期或月經前後都會出現口腔潰瘍，只能通過藥物治療暫時緩解。下個月月經期間還是會照常出現，疼痛難忍。同時還常伴有口幹、心煩、易怒、大便幹燥等惱人的癥狀。臨床研究發現，經期口腔潰瘍主要是由於體內孕酮水平升高，雌激素(黃體酮等)減少引起的。).
3.精神因素
部分患者精神緊張，情緒波動，睡眠不好，可能與植物神經功能紊亂有關。4.遺傳因素
如果父母雙方都患有復發性口腔潰瘍，大約80-90%的孩子會患病，如果父母壹方患有此病，大約50-60%的孩子會患病。
5.其他因素
如鋅、鐵、葉酸、維生素B12等微量元素缺乏、營養不良等。，會降低免疫功能，增加復發性口腔潰瘍的可能性。該病毒可能是口腔潰瘍的始動因素，但目前尚未在患者血清中發現相關抗體，也未見從口腔潰瘍的病變組織中分離出該病毒的報道。細菌對口腔潰瘍的作用已提出多年，與口腔潰瘍密切相關的細菌有血鏈球菌和幽門螺桿菌[14]。體內超氧自由基的產生和清除速率失衡，血栓素B2與6-酮前列腺素的比例失衡，整體水平下降，均可引起口腔潰瘍。微循環障礙導致血流緩慢，血流量低，毛細血管靜脈端徑擴張，缺血缺氧，導致粘膜損傷，潰瘍形成。血清缺鋅、缺鐵和高銅含量與RAU的發生有關。據報道，戒煙也會誘發口腔潰瘍。12-牙膏中的烷基硫酸鈉(SLS)可能刺激黏膜，誘發口腔潰瘍。
6.中醫病因機制:口腔潰瘍在中醫界早有記載。根據中醫理論體系，口腔潰瘍有以下病因:壹、外邪六淫，主要是燥火、燥燥、易傷津液，火為陽邪，其性質為炎性，火傷津液，引起口瘡。所以口瘡在秋季和氣候變化時容易復發。二是飲食不當，由於過食辛辣油膩之品或偏食，導致內生之熱，沿經絡進攻，熏蒸口腔舌部，常耗肺腎之陰津，而致口瘡。三是情誌過於偏激，患者在日常生活中思慮過多，心煩失眠，五情抑郁，心火過盛，上火郁結灼口，或心火下移到小腸沿經絡襲口，均可引起口上生瘡；或者在平時，有大量的郁怒，肝氣郁結，肝氣郁結，郁火上沖，陰血暗耗，導致經絡不通，經過時，經氣郁結更甚，肝火旺盛，口舌生瘡。四、身陰兩虛，患者身陰不足，或久病後陰損，虛火內生，灼口舌，甚至口舌生瘡。五是因勞累內傷，或久病傷脾，脾虛水濕，口舌生瘡；或者郁積日久化為熱，濕熱蒸也可引起口瘡。更有甚者，脾陽受損，因脾氣虛寒、濕、熱所致，沾於口上可生口瘡。六、先天檢驗不足，或長期用寒受寒，傷脾腎，脾腎陽虛，陰寒滿溢，寒濕染口舌，寒凝血瘀，長期口舌生瘡。總之，外感邪氣、六淫燥火、臟腑內傷實熱是發病的主要原因，發病的主要器官是心脾(胃)。
口腔潰瘍的治療
用過氧化氫消毒
可以使用碳硫二胺過氧化氫，其中含有過氧化氫和甘油。雙氧水可以釋放氧氣和清除細菌，氧氣泡進入微小縫隙，甘油覆蓋和保護潰瘍。
用含氧酸鉀漱口。
可以在1杯水中加入1茶匙氯酸鉀，用此溶液漱口，每天數次，可以治療口腔潰瘍。但是不要吞人。試試紅茶包。
壹些專家建議將濕紅茶包敷在潰瘍處。紅茶中含有鞣酸，有收斂作用，鎮痛效果好。用稀釋過的過氧化氫漱口
用1杯水稀釋1湯匙雙氧水，用此溶液漱口，可預防口腔潰瘍感染，加速恢復。
明礬可以防止感染惡化。
明礬是止血藥中的活性成分，可用於口腔潰瘍早期。明礬是殺菌止痛劑，能防止感染加重，但不能消除口腔潰瘍。
用氧化鎂牛奶漱口
氧化鎂可以在口腔潰瘍表面形成保護層，還具有抗菌作用。
金銀草制成的漱口水
由金銀根制成的濃茶被用作漱口水。或制成糊狀直接塗於潰瘍處，效果良好。
避免刺激性物質
咖啡、辛辣調料、橘子類水果、富含精氨酸的核果類水果(尤其是核桃)、巧克力、草莓等都會刺激口腔潰瘍，引起部分人群口腔潰瘍。所以，這類食物要忌口。
每天吃酸奶
每天吃4湯匙原味酸奶，可以把良性細菌送到口腔，對抗那些有害細菌可能有利於預防口腔潰瘍。
避免可能導致潰瘍的食物。
避免嚼口香糖、吸煙、喝咖啡、吃熱的食物以及那些已知會誘發口腔潰瘍的食物。
營養物
賴氨酸(氰酸)
每天三次，每次500毫克，空腹服用。缺乏這種氨基酸可能會導致口腔內外的口腔潰瘍。
維生素B組添加了維生素B12和葉酸，按照產品說明書空腹舌下含服。
維生素C
每日3000-8000 mg，分幾次服用。使用含有生物類黃酮的緩沖劑型。
泛酸(D5)
每天三次，每次50-100 mg是壹種抗應激維生素，是腎上腺功能所必需的。腎上腺是壹種對抗緊張的內分泌腺。
大蒜精膠囊
壹天三次，每次三粒膠囊。作為天然抗生素和免疫激活劑。
藥用植物
牛蒡、印度三葉草、寶果茶和紅苜蓿可用於治療口腔潰瘍。紅樹莓茶也很有效。
多吃洋蔥和生菜。
多吃洋蔥和生菜沙拉。洋蔥含有硫磺，有治療作用。