真菌感染多從指甲遊離端或兩側開始，早期甲板上出現白色或臟黃色斑點和小片，然後逐漸擴大直至累及整個甲板，引起甲板變色變形，指甲失去原有光澤，甲板表面凹陷。
如果真菌侵入甲板下的甲床，指甲就會變松，變成蟲蛀狀，裏面塞滿碎屑。同時，甲床上方的甲板會逐漸變厚變脆，甲板與甲床分離、斷裂、缺損，指甲顏色會變灰或變臟。有些甲板會斷裂，只留下壹部分指甲根。
灰指甲的病程很長，往往在多年以後，才逐漸累及大部分指甲。因為沒有明顯的疼痛，有些人不重視，不治療。經常在社交活動中，頻繁握手時，會因為指甲變灰不亮而自卑，才去醫院治療。
堅韌的甲板指甲是人體手指的壹個小而可靠的保護屏障，阻擋了異物的入侵。但在灰指甲的治療中，這壹特點帶來了困難，因為外用藥物很難滲入甲板，到達甲床。這就是為什麽市面上很多種類的灰指甲外用藥物都達不到治療效果的根本原因。
認真對待灰指甲
目前醫生在治療灰指甲時，應用原則是:
(1)單個手指/趾甲的甲癬，尤其是指甲根部(編者註:指甲根部是半個月後指甲近端深深嵌入皮膚的部分)，即甲癬和甲板遠端2/3的甲癬(見示意圖)。含有有效的“穿甲給藥系統”的局部治療藥物可以通過甲板擴散到甲床。比如5%的鹽酸阿莫多芬搽劑，壹周只需要用壹次。
)多甲的灰指甲，以及已經影響到甲根的灰指甲，也就是甲板附近的1/3。應使用有效的口服抗真菌藥物，如特比萘芬、伊曲康唑和氟康唑。這些口服用藥方法各不相同，都有這樣或那樣的不良反應。因此建議在專科醫生的指導下正確服用，至少間斷服用3個月以上。
由於灰指甲很難治療，我們建議手癬、體癬、股癬在經常發生癬的溫暖潮濕地區積極治療。這是預防灰指甲和灰指甲的最好措施。