時珍壹直想棄文從醫，但她懷揣著父親的成名欲望，時珍卻偷偷學起了醫術。壹天，壹個被確診為肺病的村民被時珍無意中聽到，深感古代民間偏方可以治病，於是決定上山尋找藥材。在上山的路上，世貞碰巧遇到了壹位長期便秘卻無錢求醫的老婆婆，便央求拜“藥仙”。世貞聽後，決定晚上去拜訪老婦人，卻看到壹個神秘女子出現，放下藥袋。世貞以為遇到了“藥仙”，追著她討教。神秘女子告訴她藥方後，她就消失了。第二天，世珍私自用藥方救人，讓新聞嘩然，卻發現病人真的康復了。在路上，世貞驚訝地看到壹口滿是鮮血的棺材。世貞覺得可疑，就和木蓉打算嚇跑送葬的隊伍，把屍體帶回家。最後，聽到診斷結果後，確認“屍體”還活著，兩父子決定救人。這時，官兵和群眾突然回家來抓世珍...
第二集讓父親放松壹下，加入官場
得知消息，簡參加科舉，不歡而散；後來，世貞從石國口中得知那次演講是為了保護世貞，他毫不猶豫地跪下來向景王道歉，於是決定參加科舉以答謝他的演講。他壹聽，就安排他在陽明書院跟著名儒家顧日言學習。顧日言很欣賞世貞拒絕賄賂考官的正直。世貞在陽明書院後，不但無心學習，還和顧日言勾結，整天吊兒郎當。有壹天，我碰巧遇到金水，壹個想投河自盡的漁夫。原來，金水感染了食肉菌，雙腳潰爛，城裏的醫生讓他截腳救命。世貞肯定藏了話，讓荷莉去救人。霍莉深感身為女兒難以成名，決心醫好怪病，揚名立萬，決定接手金水怪病的治療。然而，荷莉和世珍對藥理學的理解不同，所以他們決定分開尋找藥方。最後，世貞受到龐仙《濟陽方》的啟發，終於能夠對癥下藥，救了金水的腳。慕蓉為了在宮廷會議中獲得壹等獎筆，碰巧遇到了龐憲。龐獻夫看到穆容時大吃壹驚。最終，壹等獎筆落到了農夫豐收的手裏，慕蓉答應耕田收割。幸好甄路過，救了。然而，世貞對荷莉產生了愛情，卻沒有任何東西可以回報慕蓉。
第三集，簡·霍莉漸漸愛上了。
慕蓉為世貞生病，世貞卻沒有想到。他決定上山抓蛤蜊來緩解木戎的暑氣，卻碰巧遇到了荷莉，兩人漸漸相愛，這讓已有婚約的世貞很苦惱。結果，珍碰巧遇到了荷莉，國珍愛上了荷莉。那壹夜，郭震談對了人，我也不知道是我所珍愛的“妹妹藥仙”。世貞鼓勵國珍爭取合適的人，國珍如約向荷莉獻上恩情。荷莉也從國珍口中證實了世珍的心意，將國珍的好意視為世珍的授意，心中大喜。當考試期臨近時，世貞將在武昌參加考試，荷莉將立即把它送到冬青葉以示心意。世貞也決定在成名後與景王解除婚約，與荷莉結婚。恰好，郭真誤會是荷莉鼓勵他表白，便向世珍求教。世貞將玉佩送給郭貞作為定情信物，但荷莉誤會了他，便向郭貞求婚，她歡天喜地答應了。然而，當霍莉趕到渡口與簡告別時，她再次交叉雙臂。甄去武昌趕考時，看到婢女小花受了委屈，通奸懷了孕；經過診斷，世珍發現小花的肚子裏有內生菌，小花的主人就是檢查者陳達仁。陳在揭發作弊後，因個人恩怨將世貞趕出考場，又將世貞趕出客棧。荷莉趕到武昌，卻驚訝地看到病倒在街上的世貞。
第四集慕容為愛千裏走在前面。
慕容瞞著家人去武昌找世貞，卻在路上誤上了賊車。幸好龐憲救了他。另壹方面，荷莉無法照顧世珍，但世珍的病情並沒有好轉。她決定上街找父親躲在壹個小地方救世珍，卻恰好卷入了“救人殺人”的案子。當倉和荷莉回到客棧時，他們發現已經離開了，於是他們急急忙忙四處張望。原來慕容終於找到了世貞。因為世貞昏迷不醒，決定帶他出城找醫生。病重時，世貞看到慕蓉對他照顧有加，大為感動。之後，世貞的病情越來越重，慕蓉立即帶著世貞回老家求醫，終於治好了頑疾。當家人最終在考場得知世貞的遭遇時，憤怒不已，認為景王會借此機會解除婚約，讓大家都感到極大的苦惱。所以世貞也有了更多的心事，深深辜負了父親的期望，不知道如何回應慕蓉的愛。時珍病愈，郭真帶他去見“未來大嫂”，卻讓時珍發現“未來大嫂”就是荷莉，心灰意冷，決定讓愛。景王最後要求解除婚約。慕容聽後深受打擊，決定出家當尼姑。當簡聽到慕容深情的談話時，她脫口而出，她想娶她...
第五集慕容獨自嫁入李家
世貞在安堂公開答應嫁給慕容氏，遭到景王的激烈反對，但慕容氏表示除非世貞嫁出去，否則堅決不嫁，激怒了景王。最後慕容造反，獨自嫁入李家；但是婚禮後的第二天，荷莉來找世貞，發現世貞已經和別人結婚了。壹切都是誤會，霍莉憤然離開。時珍結婚成家，家裏人都讓時珍規劃未來。世貞決定行醫救人，但她害怕遭到言語和流言的反對。結果世貞跟草明確誌向，遊說他不要以功名來衡量成就，但總說行醫絕對吃力不討好，堅決反對。還好，慕蓉從側面松了壹口氣。於是，決定隱退，把魯大夫讓給施貞。另壹方面，張角開始“教導”他的新妻子，並不斷告訴慕蓉處理家務。可惜慕蓉從小嬌生慣養，在家務處理上多次失誤，讓李家叫苦不叠。林智賢病了，派壹個仆人去傳話，說是要介紹史真，史真只替他父親看病。林芝服藥後突然病危，世貞被捕入獄。後來，時珍發現王靜管理的惠民藥店的藥品有問題，最後被判無罪。時珍回到家，發現慕容的臉上有黑點...
第六集，簡救了妻子，不離不棄。
慕容臉上突然出現黑斑，才發現慕容是因為家裏的事情而緊張。雖然世貞父子盡了最大努力，還是沒能改善病情。王靜聞訊趕來，卻不歡而散；景王甚至說師真應該從醫學院畢業，但師真卻要更用心地學習醫學，在不知情的情況下冷落了慕蓉。世貞為了救妻子，整日為茶飯發愁。在山上，她碰巧遇到壹對青年男女，他們把藥仙石改名為地藏石。仔細看了之後，她才知道，這姑娘也有色素沈著的毛病。幸運的是，她被壹個醫生治好了，醫生把它放在壹個小地方。當她聽到這個消息時，她去尋找它。結果她發現，地藏王甚至多次被他惹惱。原來，地藏王知道了世珍和荷莉的關系，故意氣惱，但她執著的態度很小。後來世貞終於得知了小地藏的身份，再次見到了荷莉，但荷莉壹直懷恨在心，不肯說出治療色素沈著的秘方。結果，世貞無奈離開。世貞責怪自己沒能救回妻子，然後去了小地藏。霍莉再次斷言她拒絕了。直到世貞服毒，小迪·藏才說出秘方。霍莉立即上前制止，壹怒之下離開。世貞無奈回家，在回家的路上又遇到了荷莉。世貞給我們講了各種過去比較好的事情，讓荷莉最後同意給慕容治病。
第7集冬青補救治愈慕容。
世貞帶荷莉回家給慕蓉治病，慕蓉熱情招待。霍莉讓木蓉在給她治療前用布蒙住眼睛。原來，慕蓉是把水蛭放在臉上吸出淤血的。慕容知道治愈方法後，嚇得當場暈倒。療程完成後，慕蓉不肯照鏡子，最後發現自己恢復了容貌。世貞很欣賞蒼的醫術。在得到父親的認可後，他特意向小地藏取經。幾經努力，終於可以和荷莉成為兄妹了。施貞帶著慕容回荊探親。當王靜看到慕容復的病情好轉，他承認了他們的關系，並承諾不會封世貞義光。怕慕容故態復萌，禁止她再做家務，但看到慕容頻繁外出，她很不高興。霍莉來幫簡壹光時，被病人嘲諷為“神棍”；感謝世珍的支持。當病人突然增多時，世貞認為可能有瘟疫，小地藏同意世貞的看法。後來，他們發現病源可能來自鄰村。世貞想找王靜增加醫療經費，但被免了；世貞和父親自發設立了檢疫站，卻引起壹陣騷動，被拉回衙門。大官龐百川之子龐憲進城，急忙前去奉承。龐憲向王靜和其他人建議，可以隔離患病的居民。妳怎麽知道王靜誤會了，把生病的人抓上山等死？
第八集簡上山治病救人
時珍號召醫生們聯手對抗疾病，龐賢也主動幫忙。世貞和荷莉徹夜未眠，查方子和醫書，感情有增無減。慕蓉連夜做香包，因為世貞曾告訴她，藥可以治疫；此外，慕容為每個人準備了八寶飯，意識到她的兒媳婦要出去學習烹飪。慕容等到山上為眾人歡呼；荷莉不想吃醋，和姐姐壹起離開。龐憲決定下山，大家都罵他，但原來他下山是為了籌錢救人。小囤突然出現，晚飯點醋饅頭，甚至笑稱不生病可能與“呷醋”有關。疫情越來越猖獗，使得世珍的父親壹聽說病人生病就不願意離開病人下山休養。最後他被打暈了，被壹個小地窖逼著帶他下山。受此啟發，世貞用醋煙給家裏消毒，和父親壹起在街上發防疫傳單。時珍的身體開始出現異常，但她仍堅持要救陳波這個垂危的病人，並要求荷莉不要告訴別人。慕蓉在街上聽到世貞生病的消息，深感恐懼，不敢告訴家人。慕蓉苦苦思索要獨自上山找世貞，卻被荷莉勸住了。躲在路上，碰巧遇到壹個快死的病人，不小心餵了他壹只倉鼠。第二天病人的情況有所好轉。但是當他躲在山裏告訴所有人的時候，龐憲並不相信他。
第9集因醫學原因嘗試藥物
大家對地鼠湯還是持懷疑態度，時珍決定自己試試藥；晚上病情反復，霍莉總是整夜陪著她。翌晨世珍病得好，證明此湯有效；大家肯定會用這個湯來救病人。世貞最終成為了壹名抗病英雄，受到了英雄般的歡迎；龐憲向景王打聽慕容，未能相見。中秋之夜，世貞和慕蓉在月下度過；霍莉感到孤獨和沮喪。時珍和慕蓉喝茶的時候，遇到開錯方子的醫生就讓人難受，這讓時珍修醫書的心更加堅定。當簡去見景王時，她想讓他幫忙修改這本書。了解事情的經過後，王靜拒絕勸說，因為這需要很長時間和很多錢。世貞把書的大綱交給龐憲，希望他代為遞交。世貞發現楚王的孫子臉色不好。張角希望能盡快抱上孫子，教木蓉煲湯，按穴位取悅丈夫。慕蓉擔心世貞以後忙著寫書，沒時間生孩子。世貞對此很生氣。景王被鬼嚇到了，就讓世貞給他治病。世貞等人找到了“鬼”，抓住了它，才知道它是楚王的孫子。原來小孩子玩鬼吃燈芯是因為他們的“積累”。世貞給他開了藥就好了；楚王想給世貞賞賜，世貞婉言謝絕，說自己只想重修百草。