不同部位或不同類型潰瘍性結腸炎的治療；
①潰瘍性直腸炎:
A.初期治療:病變局限於直腸，癥狀大多較輕。可用美沙拉秦(5-氨基水楊酸)栓劑，2 ~ 3次/d，或可的松泡沫1 ~ 2次/d，每次用1栓劑。若出現栓劑不耐受，如腹部不適、直腸刺激等，可用口服柳氮磺胺吡啶片或美沙拉秦(5-ASA)代替，常可在2周內起效，之後改為維持劑量。
B.維持治療:美沙拉秦(5-ASA)栓劑長期維持治療效果較好，每晚1粒，可減少復發。栓劑不耐受的患者可以口服柳氮磺吡啶(SASP)或美沙拉秦(5-ASA)，建議的維持劑量為2 g/d柳氮磺吡啶(SASP)。註意監測血藥濃度、血紅蛋白和網織紅細胞。
②左側半潰瘍性結腸炎:初始治療常用美沙拉嗪(5-ASA)灌腸，每晚4g。如果3-4周後癥狀仍未緩解，可增加到早晚各1次。或加用氫化可的松100mg/100ml灌腸，但仍無效或患者難以耐受。可以口服添加或改用柳氮磺胺吡啶(SASP)或美沙拉秦(5-ASA)，從小劑量開始，如果可以耐受，逐漸增加劑量，如柳氮磺胺吡啶(SASP) 1g/d或。壹旦癥狀緩解，就應該逐漸減少。維持治療常用5-ASA灌腸，每次4g，每晚1次或每3晚1次，或口服SASP 1 ~ 2g/d，5-ASA 1.2 ~ 2.4g/d維持..那些長期使用SASP的人應該補充葉酸。
③右側半潰瘍性結腸炎和全結腸炎:初始治療常用柳氮磺吡啶(SASP) 4 ~ 6g/d或美沙拉嗪2.0 ~ 4.8g/d，急性發作時可加用美沙拉嗪(5-ASA)灌腸或皮質類固醇灌腸。壹旦癥狀緩解，應逐漸停止灌腸，並應減少口服柳氮磺胺吡啶(SASP)或美沙拉秦(5-ASA)以維持治療。若無效，可用口服潑尼松40 ~ 60 mg/d代替。註意補鐵，也可以加止瀉藥緩解癥狀。維持治療，柳氮磺胺吡啶(SASP) 1 ~ 2g/d或美沙拉秦(5-ASA) 1.2 ~ 2.4g/d
④重度或暴發性潰瘍性結腸炎:此類患者常出現全身癥狀，易並發中毒性巨結腸、腸穿孔，需住院觀察治療。到目前為止，主要的治療藥物是皮質類固醇。嚴重者可停用免疫抑制藥物或進行結腸切除術。主要措施是腸外營養腸道休息和靜脈註射皮質類固醇。靜脈營養與常規方法相同。皮質類固醇可每8小時靜脈輸註氫化可的松100mg，或每8小時靜脈輸註潑尼松龍30mg或甲潑尼龍16 ~ 20 mg。後兩種藥物鈉瀦留和鉀丟失的副作用較小。效果不明顯時，可聯合美沙拉秦(5-ASA)灌腸或氫化可的松灌腸，每日2次，或聯合抗生素。若皮質類固醇無效，持續靜脈滴註小劑量環孢素2mg/(kg·d)可緩解病情，避免急診結腸切除術，並適當減少皮質類固醇用量。此外，有些人使用粒細胞吸附療法，以達到更好的效果。粒細胞吸附療法是指從血液中去除活化的白細胞如粒細胞、單核細胞和殺傷T淋巴細胞，從而抑制炎癥的療法。粒細胞吸附器是壹種血液過濾器，其中填充有醋酸纖維素珠。患者的靜脈血流經其中後，約有60%的活化粒細胞和單核細胞被吸附。此療法每周1次，每次1小時，5次為壹個療程。因為這是對癥治療，所以需要定期維持治療。粒細胞吸附療法可應用於多種炎癥性疾病，有效率為58.5%，高於糖皮質激素(44.2%)，不良反應發生率僅為8.5%，而糖皮質激素占42.9%。
⑤慢性活動期潰瘍性結腸炎:當部分患者對柳氮磺吡啶(SASP)、美沙拉嗪(5-ASA)、皮質類固醇無效，但不願手術時，可采用硫唑嘌呤治療，從50mg/d開始，逐漸增加劑量，最大2mg/(kg·d)。雖然有效率在60% ~ 70%，但需要3 ~ 6個月才能見效。因此，在減少劑量之前，往往需要在治療的初始階段維持潑尼松治療至少2個月。如果6個月後硫嘌呤(6-巰基嘌呤)或硫唑嘌呤仍無效，可改為口服甲氨蝶呤(2.5mg/周)，劑量可逐漸增加至10 ~ 15mg/周，或肌註25mg/周。需要8 ~ 10周才能生效。
2.潰瘍性結腸炎的外科治療在內科治療後取得了良好的效果，但仍有20% ~ 30%的病例需要外科治療，切除病變腸段以獲得根本治愈。手術適應癥包括:
(1)藥物治療無效，長期持續或反復發作，患者營養狀況差，勞動力喪失，嚴重影響兒童生長發育。
②結腸纖維瘢痕狹窄引起的梗阻或功能障礙引起的持續性腹瀉患者。
③有或可能有癌變者。
④短期(2-3天)內科治療無效的爆發性UC或中毒性先天性巨結腸患者。
⑤急性並發癥患者，如結腸穿孔或即將穿孔者，便血多。
⑥胃腸外並發癥，尤其是關節炎惡化者。
近10年來，由於外科技術和設備的不斷發展和完善，特別是腹腔鏡和吻合器的廣泛應用，外科治療有了很大的進步，治療觀念更加更新，術後功能不斷改善，患者生活質量不斷提高。目前手術方法主要有:回腸造口術和結腸造口術；全結腸切除術和回直腸吻合術；全結腸直腸切除和回腸造口術；全結腸直腸切除術和回腸肛門吻合術。但術前應充分估計病情，明確病變範圍，合理選擇手術方式。
(1)回結腸切除術:主要用於治療全身情況較差，不能耐受腸切除的中毒性先天性巨結腸病例。采用單純回腸造口術對擴張的結腸進行減壓，病情好轉後進行二期腸切開術。但中毒性先天性巨結腸腸壁脆弱，縫合極其困難，近期多以壹期腸切開術替代手術。
(2)全結腸切除回腸直腸吻合術:該術式適用於無直腸病變者，操作簡單，術後排便功能良好。在回腸貯袋-肛門吻合術(IPAA)出現之前，這是唯壹可以避免永久性回腸造口術的手術。但保留的直腸可能會復發，甚至癌變，術後需經常隨訪內鏡檢查。目前，回直腸吻合術的臨床應用較少。
(3)全結腸切除加回腸造口術:是最徹底、最傳統的手術。將病變腸管全部切除後，雖然沒有復發、癌變的後顧之憂，但存在糞便處理困難、糞袋等諸多問題，會給患者帶來長期的生活和精神負擔。
(4)IPAA:近年來廣泛用於治療UC、家族性息肉病和壹些直腸良性疾病，是壹種理想的手術。IPAA手術是將病變的直腸粘膜和結腸全部切除，防止疾病復發和癌變，通過直腸肌鞘拉出回腸袋與肛管吻合，保留肛門括約肌和自制排便功能。盆腔儲物袋的建立是回腸肛門直接吻合術的壹大進步，大大減少了排便次數，從而取代了回腸肛門直接吻合術。
EGF階梯免疫重組療法是以生物學、分子遺傳學和現代免疫學為基礎，按照“階梯療法”的主流治療策略，在國際最新超聲電子結腸鏡的高清視覺下，對潰瘍黏膜進行靶向、毫點治療。科學地針對遺傳、環境、腸道微生物、菌群、免疫等諸多因素對炎癥性腸病的影響，利用高親和力的EGF表皮生長因子和EGF受體(EGFR)的生物學效應，有效拮抗和阻斷TNF-a的生物學活性，刺激細胞的有絲分裂活性和分化，促進上皮細胞的快速增殖和修復。積極采取激活免疫重組等手段的幹預策略，重建腸黏膜健康屏障，從而有效緩解病情，預防癌癥，提高患者生活質量。