口腔念珠菌病以局部治療為主，但重癥和慢性念珠菌病往往需要輔以全身治療才能有效。
局部藥物療法
()% ~%碳酸氫鈉(小蘇打)溶液:此藥常用於治療嬰兒鵝口瘡。用於哺乳前後清洗口腔，消除殘留的能分解產酸的凝乳或糖分，使口腔成為堿性環境，能阻止白色念珠菌的生長繁殖。輕度患兒不用其他藥物可在~天內消失，但仍需繼續服藥數天，以防復發。這種藥也可以在哺乳前後用來清洗乳頭，避免交叉感染或反復感染。
()龍膽紫溶液:龍膽紫溶液在:10000的濃度下仍能抑制念珠菌的生長，因此以/()的濃度每天塗抹壹次為宜。%)治療嬰幼兒鵝口瘡、口角炎，但不宜觀察藥物染色後損傷的變化。市售的%龍膽紫醇溶液因刺激性大，不適於直接塗於嬰幼兒口腔粘膜，但可用於皮損處。
()洗必泰:洗必泰有抗真菌作用。可局部用%溶液或%凝膠沖洗或含漱，也可與制黴菌素混合制成軟膏或乳膏，還可加入適量曲安奈德治療口腔炎和義齒性口腔炎(可將乳膏塗於義齒基托組織口部)。用洗必泰溶液和碳酸氫鈉溶液交替洗滌，可消除白色念珠菌-革蘭氏陰性菌的協同致病菌。
抗真菌藥物療法
()制黴菌素:該藥屬於烯屬抗生素mg，相當於U，不易被腸道吸收，故常用於治療皮膚黏膜和消化道白色念珠菌感染。每小時塗10000-10000 U/ml水懸液後吞服，或用漱口水漱口或制成含片乳劑，兒童(~歲)每日服用10000 U/次。這種藥的抑菌作用可能是破壞細胞膜釋放鉀，從而使胞內糖原分解停止，失去活力。口服副作用很小，偶爾會引起惡心、腹瀉或厭食~天。
()咪康唑:該藥為合成廣譜抗真菌藥，為硝酸咪康唑的國內商品名，局部使用。除抗真菌活性外，該藥還具有抗革蘭氏陽性菌的作用。該粉末可用於口腔粘膜乳膏，適用於舌炎和口角炎。
()克黴唑:為合成壹種廣譜抗真菌藥物，毒性高，在血液中0 ~小時吸收快，可進入粘膜和唾液。這種藥物可以影響麥角固醇的合成，從而使真菌細胞膜缺陷的內容物溢出，導致真菌死亡。成人每天口服兩次。這種藥的副作用主要是腸道反應。長期使用會影響肝功能，引起白細胞減少，所以目前常使用局部制劑。
()酮康唑:國外90年代後推薦使用的抗白色念珠菌新藥，能抑制真菌細胞膜的DNA和RNA，療效快，口服數小時吸收即達高峰，通過血液循環到達病變部位。劑量為mg ~周口服，每日1次，可與其他局部抗真菌藥聯合使用，對皮膚、消化道等口外真菌病療效較好。目前在國外已經替代了分枝黴素，以免影響吸收。
綜合治理
對於粘膜明顯充血水腫、舌紅、口臭、小便黃赤、大便秘結，或胃熱夾濕的患者，可服用“口炎顆粒”(見單純皰疹壹章)。
除抗真菌藥物外，對身體虛弱、免疫缺陷或相關全身性疾病、慢性念珠菌感染的患者，往往需要輔以增強免疫力的綜合治療措施，如註射轉移因子胸腺肽脂多糖等鐵補充劑維生素A；以及多次小規模輸血。
口腔念珠菌病的治療時間要適當延長，如服藥過早，容易導致病變復發，肥厚型(增生型)的療程要長壹些。據報道，白色念珠菌病的療效可達至個月，應盡早考慮手術切除。
預防
為避免產房內的交叉感染，應註意會陰產道助產士的手及所有分娩用具的消毒。
經常用溫水清洗寶寶口腔哺乳用具，煮沸消毒，保持幹燥。哺乳前，最好用鹽酸氯己定溶液清洗，然後用冷水擦拭。
孩子冬天要保護嘴唇不幹裂，糾正舔嘴唇、吸舌頭的壞習慣。
長期使用抗生素和免疫抑制劑或患有慢性消耗的患者。