如四環素類藥物，可導致骨骼發育障礙、牙齒發黃、先天性白內障等；鏈黴素、卡那黴素可引起先天性耳聾，損害腎臟；氯黴素可抑制骨髓功能，導致新生兒肺出血。紅黴素可引起肝損傷；磺胺類藥物(尤其是長效磺胺類藥物)可引起新生兒黃疸。
止痛退熱劑
阿司匹林或nonacetin可導致骨骼畸形、神經系統或腎臟畸形。
鎮靜劑
眠爾通，導致發育遲緩和先天性心臟病；安寧片導致發育遲緩；巴比妥類藥物可導致手指(腳趾)變短，鼻孔相通；氯丙嗪會導致視網膜病變。
激素
雌激素，導致上肢不足(海豹樣)，女嬰陰道腺病，男嬰女性化；孕酮、女嬰男性化和男嬰尿道下裂；可的松，無腦兒，兔唇腭裂，低體重畸形；甲狀腺素也會導致畸形。
抗腫瘤藥物
環磷酰胺可引起肢體短縮、外耳缺損、腭裂；6-硫嘌呤可導致腦積水、腦膜膨出、唇裂和腭裂。
中藥
麝香、斑蝥、水蛭、虻蟲、商陸、巴豆、矮牽牛、三棱、莪術、致畸、流產、死胎。鑒於藥物有時會導致致畸，如果有小病，懷孕初期最好不要用藥。當然不是說什麽病都不吃藥。記得在醫生的指導下服藥，選擇對胎兒無害的藥物。如果因為病情不得不服用某些藥物，在致畸敏感期使用有害藥物，為了胎兒的健康和智力，最好先對孕婦進行治療，再做人工流產，為以後懷孕保駕護航。
千萬不要盲目保胎，更不要聽信任何“偏方”、“秘方”，以免對胎兒造成更大的傷害。另外，如果需要服用中藥，可以遵醫囑或者按照說明書服藥。
其他藥物
對於那些已經絕經，但由於某種原因沒有檢查是否懷孕，並堅持服用避孕藥的女性，如果醫生已經診斷為懷孕，就應該墮胎。在因妊娠早期仍服用避孕藥而自然流產的胎兒中，有48%的胎兒染色體異常。同時，那些自然流產的胎兒還有壹些缺陷，都是避孕藥的作用。有些胎兒患有先天性心臟病和四肢短小，這往往與母親盲目服用避孕藥有關。如果想再次懷孕，必須等停藥(人工流產或自然流產)6個月後才能再次懷孕。雖然有些藥物不會通過口服進入體內，但長期在農藥倉庫或有毒化工車間工作的女性，在孕期必須從對胎兒有不良影響的環境中轉移出來，以避免藥物中毒對胎兒造成不可挽回的損害。此外，煤氣中毒也會傷害胎兒。