二是細菌性腹瀉，閣樓通風不良，或者飼料單壹，營養不足，鴿子都會引起腹瀉。如果籠子太小，無法隔斷糞便，糞便漏入上罐或下罐，病鴿糞便中的細菌就會傳染給健康的鴿子。比如沙門氏菌、大腸桿菌等病原體引起的鴿子腹瀉。士兵的大便變稀，白色或綠色。抗炎藥物應使用抗菌藥物，如諾氟沙星、環丙沙星或恩諾沙星，或口服。註意事項:定期清理鴿舍，每天要擦洗水槽時保持清潔。天熱，用毒鴿子和籠子噴個稀溶液。
寄生蟲性腹瀉鴿子腸道寄生蟲病也會引起腹瀉。鴿子由球蟲病引起，寄生蟲在鴿子的小腸和大腸內大量繁殖，使病鴿出現水樣便和腸道出血。雙氯芬酸可用於治療疾病，每支鴿香水40 mg，與暴虐球蟲病的氨芐青黴素聯合使用效果更好。註意事項:每天清除糞便。