早期癥狀與普通流感相似，包括發燒、咳嗽、喉嚨痛、身體疼痛、頭痛、寒戰和疲勞，有些還可能出現腹瀉或嘔吐、肌肉疼痛或疲勞以及紅眼。
部分患者病情可迅速進展，出現猛烈發作、突發高熱、體溫超過39℃，甚至出現重癥肺炎、急性呼吸窘迫綜合征、肺出血、胸腔積液、全血細胞減少、腎功能衰竭、敗血癥、休克和雷氏綜合征、呼吸衰竭和多器官損傷，導致死亡。
人感染豬流感的預後與感染的病毒亞型有關，大多預後良好；而H1N1感染者預後較差，死亡率約為6%。