治療包括以下幾個方面:
1，壹般治療生活方式的改變是治療的基礎。比如擡高床頭，戒煙戒酒，規律作息，葷素搭配，均衡飲食，飯後適度運動，避免馬上躺下。超重的人應該控制體重。
2.藥物治療:如果壹般治療不能改善反流癥狀，應開始正規系統的藥物治療。質子泵抑制劑具有更強、更持久的抑酸效果。目前臨床上常用的此類藥物有奧美拉唑和左妥拉唑。H2受體阻滯劑如法莫替丁和西咪替丁也可以減少胃酸分泌，但它們大多用於維持或對癥治療。胃食管反流也是壹種動力障礙性疾病，常伴有胃動力減弱或食管動力異常，可使用多潘立酮、莫沙必利、伊托必利等促動力藥物。硫糖鋁和鋁碳酸鎂可以粘附在黏膜表面作為物理屏障，減少其對黏膜的損傷。
3.並發癥的處理:胃食管反流常見的並發癥有食管狹窄和巴雷特食管。可根據情況選擇內鏡治療或手術治療。