1.小的瞼板囊腫不需要治療，但大的需要手術。
2.在結膜面垂直切開眼瞼結膜，向兩側分開露出囊壁，用尖刀小心剝離，將整個囊腫取出。若術中已破囊壁，則徹底切除囊內容物和囊壁，術後用拇指和食指按壓3 ~ 5分鐘，結膜囊塗抗生素眼膏，用無菌敷料包紮，次日取出。
3.對於兒童瞼板腺囊腫破裂形成的紫紅色肉芽腫，做壹個平行於瞼板緣的皮膚切口，盡可能完全切除所有肉芽組織，在創面撒少量鏈黴素粉，然後用7-0絲線縫2針，使皮膚閉合。
4.當出現混合感染時，應按內瞼腺炎處理，若炎癥消退後仍有包塊，則按上述方法切除。