如果肩胛骨疼痛是外傷引起的，需要積極改善甚至三維重建才能確定。肩胛骨損傷的具體程度，如果骨折脫位明顯且有手術指征，需要積極手術治療。同時，口服消炎止痛藥物和促進骨折愈合的藥物。
肩胛骨疼痛如果不是外傷引起的，可能是由於長期不良姿勢或長期重復某些動作，導致局部肌肉和筋膜慢性勞損。應積極糾正體位，避免長期不正確的姿勢，避免長時間重復某些動作，平躺在硬板床上，加強保暖，避免著涼，適當進行按摩、熱敷、針灸理療，局部痛點封閉治療，均可改善疼痛癥狀。