中藥材經過采集、加工、炮制後，除少數藥材單獨使用(稱為單方)外，大部分都是組合使用(稱為復方)。根據家畜的病情需要和用藥原則，將兩種或兩種以上藥物適當組合，共同應用，稱為配伍。獸用中草藥，配伍後，要麽發揮協同作用，要麽相互抵消，削弱原有藥效，要麽降低或消除對方的毒力或毒性。有些藥物在合作後也會產生嚴重的副作用。基於此，總結出“十八惡”“十九怕”，以保證用藥安全和療效。
方劑是根據壹定的配伍原則和治療方法，選擇適當的藥物而成。獸醫處方壹般有“主(君)、輔(臣)、佐、使”。獸用方劑是在長期診療的基礎上總結經驗，逐漸固定下來，並賦予壹定的名稱，如黃曉散、清肺散、通腸芍藥湯等。壹般是按照功效來分類的，和前面說的中藥材分類差不多。
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