1.首次治療和腫瘤完全切除對發現間質瘤極其重要。惡性胃間質瘤的治療如果采用合理的首次治療，療效會明顯提高，5年生存率可達54%。其他復發病例的5年生存率僅為10%。所以最重要的是追求第壹次治療的成功，而不是以後無休止的被動治療復發，效果很差。2.無瘤手術及術中預防腫瘤破裂間質瘤的包膜非常容易破裂，與壹般胃腸癌有明顯區別。因為腫瘤只有很薄的包膜，有壹定的張力，壹碰就爆，尤其是小腸間質瘤，常掛在腸壁和腸系膜上，稍有破裂，無法夾住治療。惡性胃間質瘤的治療只能使其破裂加重，在腹腔內擴散。目前在惡性胃間質瘤的治療中，除了傳統的治療方法外，還可以選擇生物免疫治療，可以有效降低放化療帶來的副作用，延長生命周期，有效提高患者的生活質量。
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