舌下腺囊腫有可能主要通過手術治療。以往囊腫切除或袋狀手術復發率較高。近年來，由於對其形成有了新的認識，大多數人主張舌下腺切除，即使留下壹些纖維組織囊壁，也很少有復發。術中應防止誤傷頜下腺導管、舌的動、靜脈和神經，並小心止血，防止口底血腫形成，影響術後呼吸。