墨旱蓮經常被用作豬和牛的飼料，但大多數農民不知道它的作用是什麽，所以它通常被作為雜草清除。墨旱蓮的汁液呈暗黑色，有的地方稱墨水草，味甘酸，性涼，入肝腎經，無毒，能清熱、消炎、止血、消腫、收斂、滋陰、補肝腎、清肝熱；可用於治療頭發早白、陰虛內熱型貧血、崩漏、跌打損傷、嘔血、消化道出血、血尿、慢性肝炎和痢疾。眉毛上澆汁可以促進毛發生長，口服有烏發烏發的效果。墨旱蓮常與女貞子同用，具有保肝、解毒、降酶的作用，可用於治療肝腎陰虛、失眠心煩、耳鳴頭暈、腰膝酸軟等癥。《滇南本草》載墨旱蓮“固齒烏發洗九種痔”。《本草綱目》指出墨旱蓮“需發，益腎陰”。
墨旱蓮現在作為藥材被購買。它在六月和七月開花時被收獲和曬幹。入藥時，壹般煎服，或熬膏，或搗汁，或入丸，散用，或塞絨，或研末外敷。