柑橘大實蠅每年發生壹代。成蟲在果實內產卵為害，常溫下2 ~ 4天即可孵化。卵孵化成1齡幼蟲後，幼蟲從果皮取食果實。到2齡幼蟲和3齡老熟幼蟲時，從受害果實中鉆出來鉆入沙地化蛹，鉆入沙地約5至10 cm深度，直到第二年4月氣候轉暖，蛹從土中破土而出。
柑橘大實蠅屬於柑橘類水果寄生蟲，與動物體內的寄生蟲不同，不會引起人畜疾病。同時，這種蠕蟲具有很強的隱蔽性。只有撕開橘黃色的果肉，才能發現米粒般長度的白色蛆蟲，所以很容易誤食，所以吃的時候壹定要小心。
桔小實蠅的農業防治主要有集中掩埋、焚燒幼蟲為害的黃色果實和樹下墜落的昆蟲果實，徹底消滅卵和幼蟲；冬春季節，蛹的越冬場所被破壞，蛹的滅絕影響成蟲的羽化。