1.抗炎治療:如果來自淺表軟組織，要積極進行抗炎和局部治療。壹旦形成膿腫，早期切除是加快控制感染的重要方法。由於治療不及時，容易造成肛周膿腫和肛管內瘺，形成持續性、復發性肛周膿腫；
2.切開排膿:在診斷肛周膿腫時，要註意是否由肛瘺引起。因為肛瘺在肛門內有壹個內口，在肛門外有壹個外口，壹根細長的瘺管將兩者連接起來，有時瘺管會彎曲甚至分叉。肛瘺引起的肛周膿腫，需要瘺管切開，使新的肉芽組織由內向外生長，才能徹底治愈肛瘺，使肛周膿腫消失。
肛周膿腫壹般難以自愈。如有相關癥狀，應及時到正規肛腸醫院就醫檢查和治療，避免長期加重病情。