(1)囊腫破裂再次復發後傷口自愈；
(2)手術未能幹凈地切除腺體組織，引起復發；
(3)口腔內有大量小粘液腺，外傷和手術切除後可引起鄰近粘液腺的損傷和復發；
(4)舌下腺囊腫術後復發，不切除舌下腺；
(5)術前診斷不明，尤其是舌下腺囊腫誤診為舌下黏液囊腫，造成術後復發。
治療方案
1.小涎腺粘液囊腫可引流，然後向囊腔內註入2%碘酊0.2-0.5 ml，停留2-3分鐘，再抽出碘酊。目的是破壞上皮細胞，使其失去分泌功能，不再形成囊腫。但是最常用的治療方法是手術切除。
2.舌下腺囊腫的根治方法是切除舌下腺，囊壁殘留部分不會引起復發。對於壹般情況下不能耐受舌下腺樣體切除術的患者和嬰兒，可進行簡單的包縫術，待壹般情況好轉或嬰兒長到4-7歲後再行舌下腺樣體切除術。