甲狀腺單發結節伴放射性核素掃描熱結節癌變可能性較小，可先嘗試甲狀腺素抑制治療或放射性核素治療。冷結節通常需要手術治療。凡發展迅速、質地堅硬的孤立性結節，或伴有頸部淋巴結腫大或兒童的孤立性結節，因有惡性腫瘤的可能，應盡早手術。
2.多結節性甲狀腺腫(MNG)
傳統上，MNG比單個結節患癌幾率低。但高分辨率超聲發現，很多被診斷為單發結節的患者其實是多發結節，現在認為兩者的癌癥發病率沒有太大差別。因此，MNG的治療必須首先排除惡性腫瘤。如果sTSH降低，說明甲亢。如果FNA細胞學診斷為惡性或疑似惡性，應進行手術治療。
3.囊腫的良性或惡性變性
惡變可形成囊腫，單純甲狀腺囊腫少見。所有持續性或復發性混合腫塊都應切除。
4.不可觸及的結節
近年來，由於b超、CT和MRI的發展，可以在其他檢查中意外發現不可觸及的甲狀腺小結節。這種情況多見於老年人。壹般無甲狀腺病史、甲狀腺結節和甲狀腺癌危險因素。結節小於1.5cm，需隨訪觀察。如果結節大於1.5cm，可以在超聲引導下進行FNA，然後根據細胞學結果進行進壹步治療。
5.輻射結節
接受頭頸部放療的人容易患甲狀腺癌，早則5年，晚則30年。任何人在頭部和頸部放療後出現甲狀腺結節，都應該由FNA進行診斷。