蜂蜜對胃酸分泌有雙重作用。當胃酸分泌過多或過少時，蜂蜜可以起到調節作用，使胃酸分泌正常化。若飯前1.5小時服用蜂蜜，可抑制胃酸分泌；如果服用後立即吃蜂蜜，會刺激胃酸分泌；溫蜂蜜水溶液可以稀釋胃液，降低其酸度，而冷蜂蜜水溶液可以提高胃液的酸度，刺激腸道的運動，有通便的作用。因此，胃酸過多或肥厚性胃炎患者，尤其是胃和十二指腸潰瘍患者，飯前服用溫蜂蜜水1.5小時，既能抑制胃酸分泌，又能降低胃酸，從而減少對胃黏膜的刺激，有利於潰瘍面愈合；胃酸缺乏或萎縮性胃炎患者服用冷蜂蜜水後應立即進食。神經衰弱的人可以每天睡前服用蜂蜜，促進睡眠。
蜂蜜的服用時間很有講究，壹般以飯前1 ~ 1.5小時或飯後2 ~ 3小時服用為宜。但對於胃腸疾病患者，應根據病情確定進食時間，以發揮其醫療作用。