生物工程包括五大工程，即基因工程(基因工程)、細胞工程、微生物工程(發酵工程)、酶工程(生化工程)和生物反應器工程。在這五個領域中，前兩個作用是將常規細菌(或動植物細胞系)作為特定的遺傳物質受體，使其獲得外源基因，成為可以表達超遠緣性狀的新物種——“工程細菌”或“工程細胞系”。後三者的作用是為這壹潛力巨大的新物種創造良好的生長繁殖條件並進行大規模培育，從而充分發揮其內在潛力，為人們提供巨大的經濟效益和社會效益。
生物工程的應用範圍很廣，包括農業、工業、醫學、藥物學、能源、環保、冶金、化工原料等等。它將對人類社會的政治、經濟、軍事和生活產生重大影響，為解決世界面臨的資源、環境和人類健康問題提供光明前景。