區別在於兩點:
1.“衛食健”字是2003年7月前衛生部批準的；國食健字是2003年7月由NFDA美國食品藥品監督管理局批準的保健食品批件。因為在此之前和之後，保健食品的審批和管理分別由衛生部和NFDA負責，審批是合法的。
二是因為前後有兩個完全不同的部門監管審批，管理不壹致。其中衛士健的批文是沒有有效期的，也就是說審批後的監管很難，而國仕健的批文是有五年有效期的，必須經過審查才能繼續認證和使用。因此，NFDA目前還處於對原衛生部發布的帶有健康食品、健康字樣的保健食品進行摸底調查的階段，即將出臺整改方案，整改後的審批將實現統壹管理。