但不建議長期服用舒泰清，因為它可能會有副作用，如腹瀉和陣發性腹痛。而且舒太清在準備腸道的時候，大量服用可能會引起惡心、腹脹、偶爾腹部絞痛、嘔吐、肛門不適。極少數會出現蕁麻疹、流鼻涕、皮炎等過敏反應。
壹般情況下，如果治療方法正確，可以有效緩解便秘，清腸。但患者在自主買藥時，對便秘程度的判斷存在壹定偏差。比如長期便秘的患者，腸道內已經堆積了大量的糞便。如果用輕度便秘患者的劑量，很難將腸內的幹大便完全軟化並排出體外。