1、遺傳因素：陰莖與身體其它器官壹樣，其大小及形態特點要受遺傳基因的控制與影響。
2、肥胖：專家介紹，壹些小腹部、恥骨聯合部、會陰部脂肪豐滿突出的男性，往往陰莖的發育欠佳，比起正常男性的陰莖會相對短小。的確，與肥大的身體相比，這種短小的陰莖在婚後可能會給性生活帶來壹定的困難和不理想。
3、發育與營養狀況：壹般來說，成年男性體格健壯，身材高大，其外生殖器包括陰莖、陰囊的發育也較好，陰莖可能較為粗大，反之則可能小壹些，但是值得指出的是，陰莖的大小不會與身高成正比例，常可以見到壹些身高不足1.60米的男性，其陰莖勃起時可以達到18厘米以上。